PCA和PCoA
讲解很详细：http://blog.genesino.com/2016/10/PCA/ PCA分析一般流程： 中心化（centering， 均值中心化，或者中位数中心化），定标（scale，如果数据没有定标，则原始数据中方差大的变量对主成分的贡献会很大。） 根据前面的描述，原始变量 ...
原文：pca ， nmds , pcoa 图添加分组的椭圆
对于pca , nmds, pcoa 这些排序分析来说，我们可以从图中看出样本的排列规则，比如分成了几组。 为例样本分组更加的直观，我们可以根据实验设计时的样本分组情况，对属于同一个group的样本添加 个椭圆或者其他多边形。 新版本的ggplot 中提供了stat ellipse 这个stat， 可以方便的实现上面的效果。 代码示例： 效果图如下： 通过stat ellipse 简单有方便，其中 ...
2018-01-05 13:06 0 6172 推荐指数：
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