Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合; 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis 距离; 计算环境因子的距离矩阵时,使用Euliodean 欧式距离 ...
Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析, 代码示例: 默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵 参考资料: https: www.rdocumentation.org packages vegan versions . topics adonis https: pdfs.semanticscholar.org e b aa f afdea edf f d.pdf ...
2017-12-18 10:51 0 2452 推荐指数:
Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合; 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis 距离; 计算环境因子的距离矩阵时,使用Euliodean 欧式距离 ...
这周的作业我开始得好迟啊。。。然而还是要努力做啊。。。 ××××××××××××××我是萌萌哒分割线×××××××××××××××××××××××××××××××××××× 首先,百度进入官方页面,看到这些: 也就是说,需要先安装permute和lattice包。那么,如何安装 ...
vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: 出来的结果图如下: 那么这幅图表明了什么含义呢? 首先看下输入数据 我们简单的看一下BCI这个数据,它的每一行代表了一个样本,不同样 ...
程序经常出现OOM错误,然后关键字"go pprof"搜到文章<Go程序性能分析pprof>,该文章第二步说运行程序后会生成profile文件,但是编译运行后发现生成的profile文件大小一直为0,然后关键字"go pprof profile is empty"搜到文章 ...
写在前面:现今绝大多数的网站都使用js来加载数据,传统的请求方法很难再奏效,对动态数据的爬取现在大都分为两类爬取方法: 1. 使用Selinium等自动化测试软件去模拟浏览器,这种方法几乎可以适用于所有网站,但是缺点是效率速度太慢了,如果有别的爬取方法,优先采用其他。 2. 对网页直接进行抓包 ...
randomForest 包提供了利用随机森林算法解决分类和回归问题的功能;我们这里只关注随机森林算法在分类问题中的应用 首先安装这个R包 安装成功后,首先运行一下example 通过查看函数的帮助文档,可以看到对应的example ...
准备工具 : 1 Charles : https://www.charlesproxy.com (收费) 2 夜神模拟器 : https://www.yeshen.com (免费 ...
最近总是有需要单独对某一个类型的通路进行超几何分布的p值计算,这里记录一下python包的计算方法 使用scipy的stat里面的hypergeom.sf方法进行富集分析的p值计算 hsaxxxxx AA and Linoleic metabolism KEGG pathways ...