利用python脚本,提取指定ID名称的序列 ...
提取fasta文件genome_test.fa中第14号染色体的序列,其内容如下: >chr1 ATATATATAT >chr2 ATATATATATCGCGCGCGCG >chr3 ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT >chr4 ...
Some time when you want to change the fasta seq into one line For awk: awk '/^>/&&NR>1{print "";}{ printf "%s",/^> ...
1、测试数据 2、 awk + sed实现 3、利用正则表达式及sed预存储还原 ...
同样的名为read_1.fa 的fasta文件,里面有若干序列,如: > ...
该软件对于处理FASTA/Q十分方便,省去自己编写脚本 安装 使用 序列操作(seq) Fasta/q之间以及与tab格式互换 序列信息统计 ...
该软件功能强大,兼容所有系统。 网站:http://bioinf.shenwei.me/seqkit/usage/ 下载,解压,安装seqkit软件,下载二进制文件较好。 一、序列操作: 1.取反向序列 seqkit seq test.fa -r > ...