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在安装 DESeq 这个包的最后出现上面的错误。可以看出是 Biobase 这个包有问题。重新安装此包后,再一次安装 DESeq ,安装成功。 library DESeq 出现下面问题: 缺少GenomeInfoDb包,继续安装 GenomeInfoDbData 这个包一直能完整下载,但是安装出错 于是,先把 GenomeInfoDbData 本地下载下来,再用R进行本地安装,安装成功 libr ...
2017-12-06 14:44 1 7426 推荐指数:
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安装R包(“RcppArmadillo”)失败,导致依赖该包的DESeq2 无法使用; 首先对gcc,g++升级至4.7, 但依然报错,还是安装不了RcppArmadillo; 报错如下: $ R > source("https://bioconductor.org ...
> library('ggplot2')Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 不存在叫‘colorspace’这个名字的程辑包 在安装了某个包的时候,解决依赖关系时更新 ...
1) MA图 对于MA图而言, 横坐标为该基因在所有样本中的均值,basemean = (basemean_A + basemean_B ) / 2, ...
简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析,主要也是用于RNA-Seq数据,同样也可以处理类似 ...
是为什么这两个包算出来的结果直接是logfoldchange . deseq2 包计算差异使用的是r ...
", "Suggests"))需要安装依赖的包全部安装之后,就可以了。依赖包如下:dependencies ‘doMC’, ...
说明: 开发环境:IDEA+MAVEN问题:idea错误提示:Java:程序包xxxx不存在 解决方案: 1.确保pox.xml文件没有报错,即文件上面不能有条波浪线,因为有时候有波浪线的话,会导致有些包不能自动导入。使用maven自动导包2.若maven导包后还未解决问题,点击 ...