原文:蛋白质结构模型和功能预测:Swiss-model工具的使用

Swiss model也是一款预测蛋白质结构模型的工具。网页地址:https: swissmodel.expasy.org 首先,进行常规的注册后,点击start modelling 以搜索BRCA 蛋白质为例: 进入NCBI的protein网页:https: www.ncbi.nlm.nih.gov protein ,输入要查询的BRCA 点击搜索后,选择最后的氨基酸序列: 将所有的序列黏贴后回 ...

2017-12-01 17:07 0 10979 推荐指数:

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蛋白质结构模建初探

目录 相关链接 蛋白质模建的几种方法 同源模建 折叠识别 从头预测 综合方法 实地操作&预测结果 路线 预测结果 Swiss ...

Fri Apr 17 07:19:00 CST 2020 0 592
1、蛋白质二级结构预测方法

原创 2017-05-08 omicshare.com 基迪奥生物 蛋白质二级结构预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步,二级结构是指α螺旋和β折叠等规则的蛋白质局部结构元件。不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全 ...

Thu Jun 15 22:32:00 CST 2017 0 11882
AI 预测蛋白质结构「GitHub 热点速览 v.21.29」

作者:HelloGitHub-小鱼干 虽然 AI 领域藏龙卧虎,但是本周预测蛋白质结构的 alphafold 一开源出来就刷爆了朋友圈,虽然项目与我无关,但是看着科技进步能探寻到生命机理,吃瓜群众也有点小激动。虽然不能参与这个了不起的项目,但是我们可以手持编程书籍参与 ...

Tue Jul 20 17:12:00 CST 2021 0 453
蛋白质组DIA深度学习之谱图预测

目录 1. 简介 2. 近几年发表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 简介 基于串联质谱的蛋白质组学大部分是依赖于数据库(database search ...

Thu Aug 06 00:48:00 CST 2020 0 2136
【宏蛋白质组】搜库工具简介与评估

蛋白质组数据分析相对较难,不同于常规蛋白质组分析,因为数据库太大,无法直接进行搜库匹配,需要对数据库进行优化。整理了几个发表的宏蛋白搜库分析工具。具体效果如何,还需要测试。 1.ProteoStorm 发表:ProteoStorm: An Ultrafast Metaproteomics ...

Fri Mar 20 07:00:00 CST 2020 0 1015
氨基酸,多肽,蛋白质

一、氨基,羧基和氨基酸 氨基:-NH2 氨基是基本碱基,大多数含有氨基的有机物都有一定碱的特性。氨基是一个活性大、易被氧化的基团。 羧基:-COOH。分子中具有羧(念suo)基的化合物称为羧酸。 氨基酸,结构中含有胺基和羧基,并且胺基和羧基都是直接连接在一个-CH-结构上的有机化合 ...

Mon Jul 26 07:36:00 CST 2021 0 318
 
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