软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整，用于检测共线性和同线性区域，还增加了可视化和下游分析。。MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具。 软件安装 进入官网http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm，下载安装 ...

目录 软件的安装 基因组的准备 一些细节 建议和示例 软件的安装 Python版McScan（jcvi工具包）：https://github.com/tanghaibao/jcvi 以前只有python2，现在已有python3版本，建议用py3 ...

共线性又称同线性，是一个物种的基因组中相互连锁的基因，在另一物种的基因组中也是连锁关系， 而且在两个物种的遗传图上的位置也是相同的 。 ...

本来是不会再写这个文档的，但是由于长时间没有用这个模块，这个模块不知道是我自己弄掉了，还是别的同学误删了，于是我重新安装一下。 首先下载conda，并下载好python which pip ...

目录 肿瘤基因组分析 肿瘤标准分析 高级分析 肿瘤数据库 肿瘤基因组分析 肿瘤进化过程 基本概念：germline/somatic/driver/passenger mutation 二次打击学说：生殖突变+体细胞突变 主要 ...

检验多重共线 如果发现存在多重共线性，可以采取以下处理方法。 (1)如果不关心具体的回归系数，而只关心整个方程预测被解释变量的能力，则通常可以不必理会多重共线性（假设你的整个方程是显著的）。这是因为，多重共线性的主要后果是使得对单个变量的贡献估计不准，但所有变量的整体效应仍可以较准确 ...

出处：bilibili 关联分析（Association）：在交易数据、关系数据或其他信息载体中 ...

宏基因组测序： 浓度>=50ng/ul OD260/280：1.8-2.0 DNA两次需要量>=3ug 宏基因组测序需要提供什么样品要求？ （1）提供环境微生物的基因组DNA或者扩增产物，OD值在1.8 ...