Swiss-model也是一款预测蛋白质结构模型的工具。网页地址:https://swissmodel.expasy.org/ 首先,进行常规的注册后,点击start modelling 以搜索BRCA1蛋白质为例: 进入NCBI的protein网页:https ...
I TASSER是一款用于预测蛋白质结构和功能的工具,网站链接:https: zhanglab.ccmb.med.umich.edu I TASSER 具体描述如下: I TASSER Iterative Threading ASSEmbly Refinement is a hierarchical approach to protein structure and function predic ...
2017-11-27 11:15 0 5488 推荐指数:
Swiss-model也是一款预测蛋白质结构模型的工具。网页地址:https://swissmodel.expasy.org/ 首先,进行常规的注册后,点击start modelling 以搜索BRCA1蛋白质为例: 进入NCBI的protein网页:https ...
pGen-Threader QUARK2 I-TASSER 蛋白质预测结果评分 ...
原创 2017-05-08 omicshare.com 基迪奥生物 蛋白质二级结构的预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步,二级结构是指α螺旋和β折叠等规则的蛋白质局部结构元件。不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全 ...
作者:HelloGitHub-小鱼干 虽然 AI 领域藏龙卧虎,但是本周预测蛋白质结构的 alphafold 一开源出来就刷爆了朋友圈,虽然项目与我无关,但是看着科技进步能探寻到生命机理,吃瓜群众也有点小激动。虽然不能参与这个了不起的项目,但是我们可以手持编程书籍参与 ...
目录 1. 简介 2. 近几年发表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 简介 基于串联质谱的蛋白质组学大部分是依赖于数据库(database search ...
一、modeller下载与安装 输入key码:MODELIRANJE 做下Basic Modeling 流程吧: 在python环境下运行下例 ...
宏蛋白质组数据分析相对较难,不同于常规蛋白质组分析,因为数据库太大,无法直接进行搜库匹配,需要对数据库进行优化。整理了几个发表的宏蛋白搜库分析工具。具体效果如何,还需要测试。 1.ProteoStorm 发表:ProteoStorm: An Ultrafast Metaproteomics ...
一、氨基,羧基和氨基酸 氨基:-NH2 氨基是基本碱基,大多数含有氨基的有机物都有一定碱的特性。氨基是一个活性大、易被氧化的基团。 羧基:-COOH。分子中具有羧(念suo)基的化合物称为羧酸。 氨基酸,结构中含有胺基和羧基,并且胺基和羧基都是直接连接在一个-CH-结构上的有机化合 ...