这周的作业我开始得好迟啊。。。然而还是要努力做啊。。。 ××××××××××××××我是萌萌哒分割线×××××××××××××××××××××××××××××××××××× 首先,百度进入官方页面,看到这些: 也就是说,需要先安装permute和lattice包。那么,如何安装 ...
vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: 出来的结果图如下: 那么这幅图表明了什么含义呢 首先看下输入数据 我们简单的看一下BCI这个数据,它的每一行代表了一个样本,不同样本采样的地点不同,每一列是 个物种的丰度 最终的物种累计曲线中,横坐标是样本个数,纵坐标是发现的物种个数,随着样本个数的增加,发现的物种个数也不断增 ...
2017-11-14 15:12 0 3847 推荐指数:
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1、 #ECDF指的是Emperical Cumulative Density Function,即经验累积概率密度函数 来源:http://blog.sina.com ...
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Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析, 代码示例: 默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵 参考资料: https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics ...
Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合; 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis 距离; 计算环境因子的距离矩阵时,使用Euliodean 欧式距离 ...
本文以1950年到2010年期间我国的火灾统计数据为例,数据如下所示: (0)加载数据 data<-read.csv("E:\\MyDocument\\p\\Data\\1950~20 ...
使用pROC包绘制ROC曲线 ...
正弦曲线一个周期是2π,我们要先生成x的取值范围。 可以用seq函数生成一个等差序列,步进为0.01 x=seq( 0, 2*pi, 0.01 ) pi表示π y=sin(x) plot(x,y,type='l') type='l'表示图形显示为线段,line ...