原文:R语言 vegan包计算物种累计曲线

vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: 出来的结果图如下: 那么这幅图表明了什么含义呢 首先看下输入数据 我们简单的看一下BCI这个数据,它的每一行代表了一个样本,不同样本采样的地点不同,每一列是 个物种的丰度 最终的物种累计曲线中,横坐标是样本个数,纵坐标是发现的物种个数,随着样本个数的增加,发现的物种个数也不断增 ...

2017-11-14 15:12 0 3847 推荐指数:

查看详情

安装R语言扩展vegan

这周的作业我开始得好迟啊。。。然而还是要努力做啊。。。 ××××××××××××××我是萌萌哒分割线×××××××××××××××××××××××××××××××××××× 首先,百度进入官方页面,看到这些: 也就是说,需要先安装permute和lattice。那么,如何安装 ...

Sat Nov 05 03:49:00 CST 2016 0 4301
R语言绘制KS曲线

更多大数据分析、建模等内容请关注公众号《bigdatamodeling》 将代码封装在函数PlotKS_N里,Pred_Var是预测结果,可以是评分或概率形式;labels_Var是好坏标签,取值为 ...

Wed May 23 20:24:00 CST 2018 0 1263
vegan 进行Adonis 分析

Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析, 代码示例: 默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵 参考资料: https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics ...

Mon Dec 18 18:51:00 CST 2017 0 2452
vegan 进行 Bioenv 分析

Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合; 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis 距离; 计算环境因子的距离矩阵时,使用Euliodean 欧式距离 ...

Fri Dec 15 23:44:00 CST 2017 0 1936
R语言曲线

本文以1950年到2010年期间我国的火灾统计数据为例,数据如下所示: (0)加载数据 data<-read.csv("E:\\MyDocument\\p\\Data\\1950~20 ...

Wed Jan 07 05:42:00 CST 2015 0 25220
R语言画正弦曲线

正弦曲线一个周期是2π,我们要先生成x的取值范围。 可以用seq函数生成一个等差序列,步进为0.01 x=seq( 0, 2*pi, 0.01 ) pi表示π y=sin(x) plot(x,y,type='l') type='l'表示图形显示为线段,line ...

Fri Jul 15 18:54:00 CST 2016 0 3040
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM