关于 minor allele frequency（次等位基因频率）的理解
引用自NCBI的概念（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf） Global minor allele frequency (MAF): dbSNP is reporting ...
原文：plink, vcftool计算等位基因频率（allele frequency，vcf）
计算等位基因频率有两种方式，第一种用vcftool计算： path to vcftools vcf file.vcf freq chr out filefreq 很简单的一个命令行，file.vcf指的是你要输入的vcf文件， freq表示计算等位基因频率， chr后面的 表示你要计算的区域在 号染色体，当然，你也可以选择你想计算的染色体区域，filefreq指的是输出的文件名。 结果如下图所示： ...
2017-09-20 23:17 4 3573 推荐指数：
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