生信软件工具-trim_galore
trim_galore 注意：软件工具一般会定期进行迭代更新，如果使用出现问题，请查看官方文档。 网址：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/trim_galore/ 需先安装fastqc ...
原文：使用trim_galore软件遇到的问题
我的原始测序数据是双端测序，在用trim galore软件去接头的这一步，使用的命令行是 相当然的以为软件会默认为双端测序，结果接下来一步用tophat软件mapping到参考基因组上的时候，发现mapping率只用 ，低的惊人。后来排除建库失败的可能，我去查看了trim galore运行时的日志文件，如下： 发现是single end 正确的命令行是 指定 paired参数 mapping率低的 ...
2017-09-02 10:13 0 1824 推荐指数：
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