20、BLAST比对及结果介绍
1、formatdb -i /share/nas1/huangt/project/IsoSeq/BMK170104-E545-03-a/Analysis_T01/MoveRebundant/T01/c ...
原文：Blat_类BLAST 比对工具 & GNU Parallel
Blat Blat，全称 The BLAST Like Alignment Tool，可以称为 类BLAST 比对工具 ，对于DNA序列，BLAT是用来设计寻找 及以上相似至少 个碱基的序列。对于蛋白序列，BLAT是用来设计寻找 及以上相似至少 个氨基酸的序列。 Blat 的主要特点就是：速度快，共线性输出结果简单易读。对于比较小的序列 如 cDNA 等 对大基因组的blat与blast比较比对， ...
2017-08-31 20:17 0 4220 推荐指数：
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blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对
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blastn 多加上 -task blastn-short -word_size 7 -evalue 1 -task：设置比对模式，通常情况会有一个默认task，这里要设置为blastn-short -word_size：尽可能小，这里设为7 -evalue：类似于p值的一个指标，越小说明越 ...
GNU Parallel-安装+使用
参考：https://medium.com/analytics-vidhya/simple-tutorial-to-install-use-gnu-parallel-79251120d618 Download Latest version of GNU Parallel $ wget http ...
4、在线blast比对结果解析（保守结构域）
转载：http://www.bio1000.com/experiment/fenzi/237846.html 标签： NCBI Blast LASTP 摘要 : NCBI BLAST比对结果报告分析:BLAST是NCBI开发的一款序列相似搜索程，常用在线的BLAST比对工具进行序列 ...
生信分析-windows-blast序列比对
这是一个尝试性的文章，能不能解决我要解决的问题，并不清楚。 ===本文利用NCBI的blast界面，实现将短序列比对上reference基因组，并实现变异位点可视化。===补言=== 比对常用的是NCBI网站，打开NCBI。（百度 谷歌直接搜索NCBI， 现在中国也在搭建和完善国家生物信息中心 ...