很多时候我们需要从GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载RNA-seq数据,一个典型的下载页面是https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE76381(搜 GSE76381)。 这里你会看 ...
.新建文件,命令为prefetch bash.sh 感觉命名简单粗暴啊 vi prefetch bash.sh .在新建的文件下添加一下内容 bin bash for id in seq 记住该语法 do prefetch SRR id done .给文件一个可执行权限 chmod frefetch bash.sh .添加环境变量或者将其move到 usr bin即可 添加环境变量: vi .b ...
2017-08-28 10:24 0 1734 推荐指数:
很多时候我们需要从GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载RNA-seq数据,一个典型的下载页面是https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE76381(搜 GSE76381)。 这里你会看 ...
1、prefetch SRRxxxxxx ~/ncbi/public/sra 2、fastq-dump --split-files xxxxxxsra 3、SRA、SAM以及Fastq文件高速下载方法 3.1 NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据 ...
前言 包含气象家园、个人博客的精华内容 准备&配置 正确地获取脚本和参数 下载策略及注意事项 常见问题解答(FAQ) 这四部主要针对三类不同人群: 如果你完全没有看过关于批量下载ECMWF数据的文章,那么我建议你从第1部分开始看。 如果你看了相关 ...
目录 前言 landsat数据情况简介 下载元数据 总结 一、前言 最近由于工作需要,需要下载部分landsat数据的元数据,老板大手一挥,给了十几年的landsat的path、row以及日期等,就算交待完了。于是我就开始准备吭哧吭哧到USGS官网上 ...
本人初次尝试用Python批量下载DACC的MODIS数据,记下步骤,提醒自己,数据还在下载,成功是否未知,等待结果中。。。。。。 若有大佬发现步骤有不对之处,望指出,不胜感激。 1.下载Python:https://www.python.org/downloads/ (1)在下面版本中任选 ...
目录 找序列 下序列 假设我要从NCBI中下载全部水稻的mRNA序列,如何实施? 找序列 第一步,肯定是找到相关序列。 我从ncbi taxonomy进入,搜索oryza。因为要搜索mRNA核酸序列,从此选择nucleotide,点击Go: 注意 ...
首先从上交所和深交所整理股票代码和上市时间,整理为下图: 上交所:产品-股票-股票列表-下载(http://www.sse.com.cn/assortment/stock/list/share/) 深交所:市场数据-股票-股票列表-下载(http://www.szse.cn/market ...
因为在写本科毕业论文的时候需要在NASA下载数据,不知道批量下载的方法,就用了很笨的一个方式,一个一个的点着下载了三年的数据。后来尝试了很多种下载方法,但效果都不理想。在机缘巧合之下得知可以利用Firefox批量下载,瞬间觉得像发现新大陆一样。下面是详细步骤(下载数据起来简单粗暴 ...