是为什么这两个包算出来的结果直接是logfoldchange . deseq2 包计算差异使用的是r ...
安装R包 RcppArmadillo 失败,导致依赖该包的DESeq 无法使用 首先对gcc,g 升级至 . , 但依然报错,还是安装不了RcppArmadillo 报错如下: R gt source https: bioconductor.org biocLite.R gt biocLite DESeq BioC mirror: https: bioconductor.org Using Bi ...
2017-02-16 13:15 0 2410 推荐指数:
是为什么这两个包算出来的结果直接是logfoldchange . deseq2 包计算差异使用的是r ...
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在安装‘DESeq2’这个包的最后出现上面的错误。可以看出是‘Biobase’这个包有问题。重新安装此包后,再一次安装‘DESeq2’,安装成功。 library('DESeq2')出现下面问题: 缺少GenomeInfoDb包,继续安装 ...
1) MA图 对于MA图而言, 横坐标为该基因在所有样本中的均值,basemean = (basemean_A + basemean_B ) / 2, ...
简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析,主要也是用于RNA-Seq数据,同样也可以处理类似 ...
如何安装R语言包详见: Linux安装R语言包 使用公共路径上的R软件,如何拥有自己的library: R中用.libPaths()函数查看lib路径,如果有多个lib,install.packages()默认是安装在第一个目录下 修改.bashrc文件中R lib路径的环境变量 ...
installing via 'install.libs.R' to C:/Program Files/R/R-3.6.0/library/00LOCK-stringi/00new/stringi downloading the ICU data library (icudt) output ...
今天看论文,需要用到R语言的库,于是又折腾了半天.. 其实并没有什么太大的问题,只是在第三方包的下载方面还有python中使用R方面遇到了问题: 第三方包的导入 其实在网上有很多的方法了,R中包的安装 先说结论:最推荐直接使用install ...