原文:扩增子统计绘图1箱线图:Alpha多样性

绘制Alpha多样性线箱图 绘图和统计全部为R语言,建议复制代码,在Rstuido中运行,并设置工作目录为存储之前分析结果文件的result目录 运行前,请在Rstudio中菜单栏选择 Session Set work directory Choose directory ,弹窗选择之前分析目录中的result文件夹 安装相关软件包,如果末安装改为TRUE运行即可安装 if FALSE sour ...

2017-08-23 21:54 0 1260 推荐指数:

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扩增子图表解读1线图Alpha多样性

线图 形图(Box-plot)又称为盒须图、盒式图或线图,是一种用作 显示一组数据分散情况资料的统计图。因形状如箱子而得名。在宏基因组领域,常用于展示样品组中各样品Alpha多样性的分布 第一种情况,最大或最小值没有超过1.5倍箱体 ...

Wed Aug 02 05:48:00 CST 2017 0 2262
多样性计算的各种距离

)或物种组成的差异(数据集内物种组成的异质的非定向过程)。 下图展示了Alpha多样性、Beta多样性和 ...

Fri Dec 27 03:57:00 CST 2019 0 1234
推荐系统多样性

  来自于:Joseph A. Konstan & John Riedl   推荐系统还有另外两大特点,也对你最终看到的推荐结果有着显著的影响:第一,在弄清楚你和其他购物者的相似度有多高之前 ...

Mon Feb 29 22:42:00 CST 2016 0 2405
扩增子分析QIIME2-1简介和安装

QIIME2是微生物组分析流程QIIME(截止17.7.13被引7771次)的全新版(不是升级版),采用python3全新编写,并于2018年1月全面接档QIIME,是代表末来的分析方法标准(大牛 ...

Fri Sep 15 16:51:00 CST 2017 0 1450
扩增子分析解读5物种注释 OTU表操作

本节课程,需要先完成《扩增子分析解读》系列之前的操作 1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 4去嵌合体 非细菌序列 生成代表序列和OTU表 分析前准备 ...

Thu Aug 24 05:31:00 CST 2017 0 2740
 
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