参考基因组下载 基因组各版本的对应关系http://www.bio-info-trainee.com/1469.html GRCh36 (hg18): ENSEMBL release_52. GRCh37 (hg19): ENSEMBL release_59/61/64/68/69/75. ...
任务列表 .在UCSC下载hg 参考基因组 .从gencode数据库下载基因注释文件,并且用IGV去查看感兴趣的基因的结构,比如TP ,KRAS,EGFR等等。 .截图几个基因的IGV可视化结构 .下载ENSEMBL,NCBI的gtf,也导入IGV看看,截图基因结构 .了解IGV常识 在UCSC下载hg 参考基因组 hg GRCH ensembl 这 种基因组版本应该是大家见得比较多的了,国际通 ...
2017-08-11 01:00 0 6094 推荐指数:
参考基因组下载 基因组各版本的对应关系http://www.bio-info-trainee.com/1469.html GRCh36 (hg18): ENSEMBL release_52. GRCh37 (hg19): ENSEMBL release_59/61/64/68/69/75. ...
作业要求: 在UCSC下载hg19参考基因组,我博客有详细说明,从gencode数据库下载基因注释文件,并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构,比如TP53,KRAS,EGFR等等。 作业,截图几个基因的IGV可视化结构!还可以下载ENSEMBL,NCBI的gtf,也导入IGV看看,截图基因结构 ...
参考基因组版本命名参考基因组联盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等机构组成。GRC 利用最佳的技术装配,纠正,增加基因组序列,以此作为在生信分析领域作为参考的基因组。人基因组官名叫 GRCh38 (Genome ...
基因组注释主要包括四个研究方向:重复序列的识别;非编码RNA的预测;基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1 重复序列的识别。 1.1 重复序列的研究背景和意义:重复序列可分为串联重复序列(Tendam repeat)和散在重复序列 ...
作业要求: 我们统一选择p<0.05而且abs(logFC)大于一个与众的基因为显著差异表达基因集,对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分析。 然后把表达矩阵和分组信息分别作出cls和gct文件,导入到GSEA软件分析。 基本任务是完成这个分析。 【1】环境 ...
从三大核酸数据库NCBI、Ensembl、UCSC 下载参考序列及注释文件 0.人类基因组版本对应关系 NCBI Ensembl UCSC GRCh36 release_52 hg18 ...
目录 1. ncRNA 2. 软件 tRNA注释 rRNA注释 其他ncRNA注释 3. 注释 tRNA rRNA snRNA、miRNA等 4. snRNA、miRNA等结果的统计 ...
基因组水平以及转录组水平研究技术 1/20/2016 0 Comments ...