【转录组入门】3：了解fastq测序数据
操作：需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质量 作业：理解测序reads，GC含量，质量值，接头，index，fastqc的全部报告，搜索中文教程 具体步骤 【1】SRA文件转换成fastq文件 ...
原文：转录组入门(3)：了解fastq测序数据
sra文件转换为fastq格式 fastq dump h split 也就是说如果SRA文件中只有一个文件，那么这个参数就会被忽略。如果原文件中有两个文件，那么它就会把成对的文件按 .fastq， .fastq这样分开。如果还出现了第三个文件，就意味着这个文件本身是未成配对的部分。可能是当初提交的时候因为事先过滤过了一下，所以有一部分数据被删除了。 gzip 输出文件压缩成gzip格式 通常gz ...
2017-08-08 00:37 0 3962 推荐指数：
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