原文:扩增子、宏基因组测序问题集锦

扩增子常见问题 实验室检测的DNA浓度很高,送到公司检测之后浓度却比较低呢 老师在实验室多采用Nanodrop对DNA浓度进行检测,而在公司我们会结合Qubit Nanodrop 琼脂糖电泳三种方法检测DNA样品的质量 由于不同检测方法的原理不同,所以检测出的结果也会存在一定的差异。其中,Nanodrop检测法是基于紫外分光光度原理进行检测,由于DNA样品中可能含有部分杂质,因此会造成结果虚高的 ...

2017-08-03 00:13 0 3044 推荐指数:

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宏基因组测序及分析

宏基因组测序: 浓度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA两次需要量>=3ug 宏基因组测序需要提供什么样品要求? (1)提供环境微生物的基因组DNA或者扩增产物,OD值在1.8 ...

Wed Aug 02 05:39:00 CST 2017 0 1129
16S测序宏基因组测序的区别

https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ http://www.sohu.com/a/146620511_769248 宏基因组测序(MetagenomicsSequencing)是对环境样品中全部微生物的总DNA(也称宏基因组 ...

Mon Feb 03 06:18:00 CST 2020 0 2809
WGA(全基因组扩增)技术

作为一种增加有限DNA量的方法,全基因组扩增技术于1992年出现,该方法特别适于法医学鉴定和遗传疾病的研究,以及如二代测序技术和CGH阵列(比较基因组杂交)等新技术应用,后者的主要难题就在于DNA样本数量有限,但分析需求量又很可观。目前业界已经开发出多种WGA技术,它们之间的实验 ...

Fri Dec 13 04:23:00 CST 2019 0 661
PacBio全基因组测序和组装

PacBio公司的业务范围也就5个(官网): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencing Epigenetics 其中全基因组测序应该是PacBio ...

Sun Nov 27 04:15:00 CST 2016 0 1379
在物种水平上的宏基因组比对分析流程

文章链接:http://biorxiv.org/content/early/2016/10/15/081141 作者:Yee Voan Teo, Nicola Neretti 时间:2016.10.15 摘要: 许多宏基因组分类工具在宏基因组学领域 ...

Sun Nov 20 19:26:00 CST 2016 0 1550
MetaPhlAn 2:宏基因组进化分析

描述 MetaPhlAn是分析从物种水平分辨率宏基因组鸟枪法测序数据的微生物群落(细菌,古细菌,真核细胞和病毒)的组成的计算工具。从版本2.0,MetaPhlAn还能够确定具体的菌株(在将样品含有先前测序的菌株的不那么频繁的情况下),并跟踪跨越样品菌株的所有物种。 MetaPhlAn 2依靠 ...

Thu Nov 17 18:20:00 CST 2016 0 1768
基因组测序及数据分析基础

华大的春季培训课程之一:https://ke.qq.com/course/1128997?taid=7160092735650341,我认为讲得很好,介绍全面而详细,加了一些个人经验(侵删)。 ...

Sun Mar 29 07:49:00 CST 2020 0 908
 
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