GTF文件的全称是gene transfer format，主要是对染色体上的基因进行标注。怎么理解呢，其实所谓的基因名，基因座等，都只是后来人们给一段DNA序列起的名字而已，还原到细胞中就是细胞核里面的一条长长的染色体（DNA序列）。而这个GTF文件的主要功能，就是指出我们所谓的基因在染色体 ...

转自：https://blog.csdn.net/sinat_38163598/article/details/72851239 1.基本 GFF和GTF是两种最常用的数据库注释格式，基因注释文件。 GFF全称为general feature format，这种格式主要是用来注释基因组 ...

我们在做生物分析的时候，经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字，甚至连内容都极为相似~那么，他们究竟差在哪里呢？ GFF全称为general feature format，这种格式主要是用来注释基因组。 GTF全称为gene transfer ...

工具推荐：https://github.com/openvax/gtfparse 真不敢相信，Linux自带的命令会这么强大，从gtf中提取出需要的transcript，看起来复杂，其实一个grep就搞定了。 grep -F -f out.list gffcmp.combined.gtf ...

hg19有哪些染色体？ chr1 chr2 chr3 chr4 chr5 chr6 chr7 chr8 chr9 chr10 chr11 chr12 chr13 chr14 chr15 chr ...

我们生信技能书有一篇介绍bedtools的文章，可以在微信里搜着看下，非常有用。 bedtools 用法大全 http://bedtools.readthedocs.io/en/latest/ gtf转bed用Linux命令完全可以实现，因为gtf每一行比较规律，不像fasta和fastq ...

1）gff3及gtf2简介 一个物种的基因组测序完成后，需要对这些数据进行解读，首先要先找到这些序列中转录起始位点、基因、外显子、内含子等组成元件在染色体中的位置信息(即注释)后才能再进行深入的分析。gff/gtf是贮存这些注释信息的两种文件格式。 GFF(general feature ...

1 - 什么是构建？ 我们都知道，写完代码之后需要进行编译和运行，以笔者自身为例，使用 Eclipse 写完代码，需要进行编译，再生成 war 包，以便部署到 Tomcat。 　　 ...