【文章推荐】12、geo数据上传

上传RNA-seq数据到NCBI GEO数据库 | 单细胞RNA数据上传 SRA - NCBI example - NCBI 要发文章了，审稿时编辑肯定会要求你上传NGS测序数据。一般数据都是放在集群，不可能放在个人电脑上，因为有的数据大的吓人 ...

SRA - NCBI example - NCBI 要发文章了，审稿时编辑肯定会要求你上传NGS测序数据。一般数据都是放在集群，不可能放在个人电脑上，因为有的数据大的吓人（几个T）。所以我们就建一个文件夹，然后把所有需要的fastq文件链接到这个文件夹就行了（copy太慢，也太占空间 ...

GEO/SRA数据库

GEO数据库 GEO数据库隶属于NCBI，是最大最全面的基因表达数据库，主要是芯片和转录组测序数据。除储存数据外，也提供一些数据挖掘工具，因此利用好这个数据库，没有实验，没有自己的数据也能发好文章！ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo ...

redis GEO数据类型

edis目前已经到了3.2版本，3.2版本里面新增的一个功能就是对GEO(地理位置)的支持。地理位置大概提供了6个命令，分别为： GEOADD GEODIST GEOHASH GEOPOS GEORADIUS GEORADIUSBYMEMBER 具体的功能 ...

GEO数据下载及处理详细过程

GEO2R 如果出现提示，请指定GEO系列加入和平台。单击“定义组”并输入您计划比较的样品组的名称，例如测试和控制。将样本分配给每个组。突出显示Sample行，然后单击组名称以将这些Samples分配给该组。使用样本元数据（标题，源和特征）列可帮助 ...

Elasticsearch(GEO)数据写入和空间检索

Elasticsearch简介什么是 Elasticsearch? Elasticsearch 是一个开源的分布式 RESTful搜索和分析引擎，能够解决越来越多不同的应用场景。本文内容本文主要是介绍了ES GEO数据写入和空间检索，ES版本为7.3.1 数据准备 Qgis使用渔网 ...

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跟着jmzeng学习GEO数据分析-GEO42872_1

##当本地存在GSE42872...gz这个文件时，getGEO会从本地读取。 > class(gset)[1] ...