原文:一个全基因组重测序分析实战

Original 曾健明生信技能树 这里选取的是GATK best practice是目前认可度最高的全基因组重测序分析流程,尤其适用于人类研究。 PS:其实本文应该属于直播我的基因组系列,有两个原因把它单独拿出来, 首先,直播我的基因组阅读量太低了,可能是大家觉得错过了前面的,后面的看起来没有必要,这里我可以肯定的告诉大家,这一讲是独立的,而且是全流程,你学好了这个,整个直播我的基因组就可以不 ...

2017-07-01 23:49 0 10268 推荐指数:

查看详情

基因组测序基础及高级分析知识汇总

基因组测序基础及高级分析知识汇总 oddxix 已关注 2018.09.20 17:04 字数 11355 阅读 212评论 0喜欢 6 转自:http://www.360doc.com/content/18/0208/11 ...

Sat Oct 20 03:46:00 CST 2018 0 3378
基因组测序 从头测序(de novo sequencing) 测序(re-sequencing)

基因组测序 基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和测序(re-sequencing)。 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序,利用生物信息学分析方法进行拼接、组装,获得该物种的基因组 ...

Fri Oct 19 19:16:00 CST 2018 0 13208
PacBio基因组测序和组装

PacBio公司的业务范围也就5个(官网): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencing Epigenetics 其中基因组测序应该是PacBio ...

Sun Nov 27 04:15:00 CST 2016 0 1379
基因组测序分析

基因组测序: 浓度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA两次需要量>=3ug 宏基因组测序需要提供什么样品要求? (1)提供环境微生物的基因组DNA或者扩增产物,OD值在1.8 ...

Wed Aug 02 05:39:00 CST 2017 0 1129
基因组测序WGS数据分析——1.DNA测序技术》学习笔记

WGS(Whole Genome Sequencing) 指将物种细胞里面完整的基因组序列全部DNA,检测并排列,此技术几乎能够鉴定出基因组上任何类型的突变。 对于人类来说,基因组测序的价值是极大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之间的内在关联性,当然也意味着更大的数据解读 ...

Tue Jun 29 19:59:00 CST 2021 0 161
基因组鸟枪法测序策略(WGS)

基因组鸟枪法测序是在获得一定的遗传及物理图谱信息的基础上,绕过bac克隆逐个排序的过程,将基因组DNA分解成2kb左右的小片段进行随机测序,辅以一定数量的10kb的克隆和bac克隆的末端测序,利用超级计算机进行整合进行序列组装的测序过程。 基因组鸟枪法测序的主要步骤 ...

Fri Dec 13 03:29:00 CST 2019 0 412
基因组测序WGS数据分析——1.DNA测序技术》学习笔记WGS

WGS(Whole Genome Sequencing) 指将物种细胞里面完整的基因组序列全部DNA,检测并排列,此技术几乎能够鉴定出基因组上任何类型的突变。 对于人类来说,基因组测序的价值是极大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之间的内在关联性,当然也意味着更大的数据解读 ...

Fri Jul 02 02:01:00 CST 2021 0 204
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM