多序列比对-muscle & trimal
2021年了，从零开始几个字可以去掉了，做了很多次服务器搭建，其实能够叫零的之前已经是讲完了。 其实应该做一个总结，但是没有时间，后面再说吧。 本文也没有什么内容，因为很简单： 首先， conda install orthofinder # 安装muscle iqtree ...
原文：muscle 软件进行多序列比对
今天在使用muscle 软件进行多序列比对时，发现输出的结果全部为gap, 而且还没有明显的报错信息 找了很久之后，终于发现了问题 muscle 为了追求速度，对输入序列的个数和长度进行了限制 下面是官方说明文档中的原话： 我的输入序列长度为 k 左右, 最终输出的结果全部为gap 经过测试，我发现序列数大于 的时候，只要长度没有太长，结果也是正常的 所以，muscle 的缺陷就是对于太长的输入序 ...
2017-06-27 14:20 0 2409 推荐指数：
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文章转载于 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比对（或多序列联配，multiple sequence alignment，MSA），是指把多条（3 条或以上）有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对，尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一 ...
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