原文:在python中将一个文件的某列替换另一个文件的某列

因为我们测序的时候,引物用的是hg 作为参考序列的,但是就目前来说,hg 注释信息更为丰富。因此,我们决定将call出来的hg 的snv位点转化为hg ,进而用annovar进行注释。 之前有一篇转载的博文,就如何将不同类型的参考基因组进行转换。我们用已经转化好的bed chrom,start,end, 文件去替换用varscan call 出来的位点信息就好。脚本如下, 跑一下,输出到某个文件就 ...

2017-06-21 16:34 0 1751 推荐指数:

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Python-工具-批量替换EXCLE文件中某的值

由于工作的原因,经常需要查询统计各地数据,有时结果收集上来后发现需要对其中某些的数据进行转换,例如将代码值转成中文含义。 重新统计需要花费时间和运维精力,所以自己写了一个简单的替换脚本。当然,理想状态还是在查询统计前就把要求确认。 下面的代码复制到.py文件中,安装 ...

Sat Oct 05 17:31:00 CST 2019 0 1597
[python]MergeTxt按合并同一个文件下多个txt文件

开发需求:应项目需要,要将记录成txt的实验数据进行按合并(也即为不同文件上下合并),从而进行机器学习训练. 实验数据类似如此 模拟验证数据 运行结果 最终结果 ...

Wed Mar 10 19:02:00 CST 2021 0 257
Python另一个文件导入变量

在写Python脚本时,我们可能希望从另一个脚本里面导入变量,分享下方法 文件A名为test1.py,变量名为localhost_hostname localhost_hostname = run_cmd("cat /etc/host_name")[1] 文件B名为 ...

Tue Jul 13 18:41:00 CST 2021 0 325
python 拷贝某个文件另一个目录下

python的shutil包含有很多文件拷贝的函数,各种各样的,要实现我文章题目的目的,使用shutil.copy函数即可 shutil.copy(文件的路径,另一个目录) ...

Mon Dec 17 18:21:00 CST 2018 0 6384
python中执行另一个py文件

使用命令:os.system('python file_name.py') 解释:os.system是执行当前的系统命令 1、拿windows系统举例: 2、linux: 例子较多,就不一一举例了。。。 ...

Wed Apr 29 06:06:00 CST 2020 0 3290
如何调用另一个python文件中的代码

无论我们选择用何种语言进行程序设计时,都不可能只有一个文件(除了“hello world”),通常情况下,我们都需要在一个文件中调用另外一个文件的函数呀数据等等,总之要操作其他文件中的代码,在Java中,只要在同一个文件目录下,我们就不需要通过import导入,但是在Python中 ...

Mon Jul 10 23:56:00 CST 2017 0 40702
 
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