原文:5、bam格式转为bigwig格式

Bam bigwig 工具 https: www.researchgate.net publication Bam bigwig a tool to convert bam files into bigwig for UCSC Genome Browser tutor file: http: files.cnblogs.com files renping bam bigwig.pdf 通过chi ...

2017-06-15 15:11 0 2348 推荐指数:

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bigBed及bigWig格式

-----------------------------bigBed--------------------------------- 1、bigBed格式 BigBed文件是使用bedToBigBed程序从BED类型文件创建的。结果得到的bigBed文件是二进制索引文件。bigBed文件 ...

Sat Dec 28 18:16:00 CST 2019 0 1983
bam文件格式说明

bam文件说明 bam文件和sam文件内容其实是一样的,只是bam是二进制的压缩文件,需要通过特定的软件来进行查看,bam文件通常可以理解为12个字段组成 BAM格式分为header section(头部分,注释信息,以@开头,可有可无)和alignment section(比对 ...

Fri May 24 21:55:00 CST 2019 0 2387
bam/sam格式说明

在SAM输出的结果中每一行都包括十二项通过Tab分隔(\t),从左到右分别是: 1 QNAME,序列的名字(Read的名字) 2 FLAG, 概括出一个合适的标记,各个数字分别代表 1 ...

Fri Apr 08 17:24:00 CST 2016 0 6291
bam/sam 文件格式详解

sam/bam 是一种序列比对格式标准,由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。通常是把FASTQ文件格式的测序数据比对到对应的参考基因组版本得到的。 header 部分 sam 分为两部分,注释 ...

Tue Jun 01 01:27:00 CST 2021 0 1389
文件格式——Sam&bam文件

Sam&bam文件 SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。当测序得到的fastq文件map到基因组之后,我们通常会得到一个sam或者bam为扩展名的文件 ...

Wed May 03 19:38:00 CST 2017 0 12667
将DOS格式的shell脚本转为UNIX格式

shell脚本是UNIX格式,在修改其中内容时,务必保持UNIX格式。UE编辑器打开时,会询问是否转为DOS格式,请点否。如果修改完成后,不能确认是否为DOS格式,可以使用UE文件菜单下的Conversions转换为UNIX格式。 在Linux下可以是用“cat –A filename”来查看 ...

Fri Jan 04 19:44:00 CST 2019 0 1838
把Java对象转为xml格式

主要使用到的Java类有:javax.xml.bind.JAXBContext,javax.xml.bind.Marshaller(编排) 代码主要展示如下: 测 ...

Thu Apr 23 06:30:00 CST 2015 0 5700
 
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