目录 相关链接 蛋白质模建的几种方法 同源模建 折叠识别 从头预测 综合方法 实地操作&预测结果 路线 预测结果 Swiss ...
原创 omicshare.com基迪奥生物 蛋白质二级结构的预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步,二级结构是指 螺旋和 折叠等规则的蛋白质局部结构元件。不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全 蛋白 全 蛋白 蛋白和 蛋白等四个折叠类型。预测蛋白质二级结构的算法大多以已知三维结构和二级结构的蛋白质为依据,用过人工神经网络 遗传算法等 ...
2017-06-15 14:32 0 11882 推荐指数:
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作者:HelloGitHub-小鱼干 虽然 AI 领域藏龙卧虎,但是本周预测蛋白质结构的 alphafold 一开源出来就刷爆了朋友圈,虽然项目与我无关,但是看着科技进步能探寻到生命机理,吃瓜群众也有点小激动。虽然不能参与这个了不起的项目,但是我们可以手持编程书籍参与 ...
I-TASSER是一款用于预测蛋白质结构和功能的工具,网站链接:https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ 具体描述如下: I-TASSER (Iterative Threading ASSEmbly Refinement ...
Swiss-model也是一款预测蛋白质结构模型的工具。网页地址:https://swissmodel.expasy.org/ 首先,进行常规的注册后,点击start modelling 以搜索BRCA1蛋白质为例: 进入NCBI的protein网页:https ...
目录 1. 简介 2. 近几年发表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 简介 基于串联质谱的蛋白质组学大部分是依赖于数据库(database search ...
一、氨基,羧基和氨基酸 氨基:-NH2 氨基是基本碱基,大多数含有氨基的有机物都有一定碱的特性。氨基是一个活性大、易被氧化的基团。 羧基:-COOH。分子中具有羧(念suo)基的化合物称为羧酸。 氨基酸,结构中含有胺基和羧基,并且胺基和羧基都是直接连接在一个-CH-结构上的有机化合 ...
概念 利用蛋白质组学数据,结合基因组数据(DNA)、转录组数据(RNA)来研究基因组注释问题,被称为蛋白质基因组学。“蛋白质基因组学”一词由Jaffe 等于2004 年首次提出,作者采用串联质谱数据匹配DNA翻译得到氨基酸序列的方法,在仅有810 kb 大小的细菌基因组上直接鉴定开放阅读框 ...
目录 1.简介 2.安装运行 3.结果 1.简介 MSGF+也是近年来应用得比较多的蛋白鉴定软件。java写的,2008年初次发表JPR,2014年升级发表NC,免费开源,持续更新维护,良心软件。而且,有研究者对不同蛋白质组学鉴定软件进行比较分析 ...