原文:12、IGV-Integrative Genomics Viewer

IGV的网址:http: software.broadinstitute.org software igv java环境 常见的几种输入格式bam sam 比对文件 TDF bam的精简版 bed 注释文件 gtf gff 注释文件 PSL blat比对结果 VCF snp,indel的信息 WIG UCSC数据库推荐格式wiggle track format IGV IGV默认的格式 操作指南 ...

2017-06-04 22:12 0 2076 推荐指数:

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Integrative Genomics Viewer (IGV)

http://software.broadinstitute.org/software/igv/igvtools_commandline Running igvtools from the Command Line Downloading ...

Sat Mar 18 00:41:00 CST 2017 0 1537
IGV解读

复制于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html 整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据。它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释。IGV这个工具很牛,发了NB ...

Fri Jul 26 02:13:00 CST 2019 0 1016
[Linux] IGV使用说明

做完mapping之后,需要知道mapped reads在基因组上的分布,所以尝试在ubuntu系统中使用IGV软件,简单记录使用过程,如下:1.下载IGV软件  去IGV官网: http://www.broadinstitute.org/software/igv/download,下载 ...

Sat Mar 18 05:14:00 CST 2017 0 4245
VNC Viewer

首先需要明确,什么事VNC , Virtual Network Computing ,VNC允许Linux系统可以类似实现像Windows中的远程桌面访问那样访问Linux桌面。 首先试试服务器装了 ...

Sat Apr 29 21:56:00 CST 2017 0 2489
单细胞测序 10x genomics

单细胞转录组 从研究方向看上,发育生物学、免疫、神经生物学、肿瘤是排名靠前的方向,这和我们平时遇到的高频研究方向基本吻合。另外,作为一个新兴的领域,10X 单细胞转录组检测到细胞多,数据庞大, ...

Thu Jul 01 01:14:00 CST 2021 0 223
什么是SCADA Viewer

SCADA Viewer 什么是SCADA Viewer SCADA Viewer是一个基于Web的软件框架(基于Web的HMI/SCADA/M2M工业和楼宇自动化,支持Modbus,BACnet,OPC,SQL...),应用程序开发人员可以用它来构建轻量级的,完全定制的过程控制 ...

Tue Jan 03 21:45:00 CST 2017 0 6149
单细胞 RNA-seq 10X Genomics

单细胞流程跑了不少,但依旧看不懂结果,是该好好补补了。 有些人可能会误会,觉得单细胞的RNA-seq数据很好分析,跟分析常规的RNA-seq应该没什么区别。今天的这篇文章2015年3月发表在N ...

Sat May 27 00:06:00 CST 2017 0 13409
 
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