PacBio下机数据解读
今天被人问起如何看懂三代的下机数据，虽然解决了别人的问题，但感觉自己还是没有搞透。 基本的目录结构： 解压后的目录结构： 可以看到数据是以HDF5的格式存储的，格式介绍：PacBio Sequences的HDF5格式 那么，上面目录和文件名都有哪些含义呢？仔细 ...
原文：pacbio 原始下机数据h5 文件简介
pacbio 采用hdf 文件格式保存原始的下机数据，对于RS 测序系统而言，会产生一个 bas.h 的文件 以bas.h 文件为例，看一下有下机数据中保存了那些信息 h dump 工具可以用来查看h 文件的内容： 我从HGAP的wiki 页面下载了一个测试用的h 文件，文件名为m c s p .bas.h 运行下面命令： 可以看到这个文件中所有的group和dataset, 由于结果太多，只展示 ...
2017-05-26 15:49 0 1392 推荐指数：
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3、PACBIO下机数据如何看
转载：http://www.cnblogs.com/jinhh/p/8328818.html 三代测序的下机数据都有哪些，以及他们具体的格式是怎么样的（以sequel 平台为主）。 测序过程 SMRTbell A adapter通用接头，两端的接头可以一样也可以不一样 B ...
PacBio下机数据如何看？
一开始拿到三代测序的下机数据时，蒙了，readme ？三代测序的下机数据都有哪些，以及他们具体的格式是怎么样的（以sequel 平台为主）。 测序过程 SMRTbell A adapter通用接头，两端的接头可以一样也可以不一样 B barcode(客户自己设计) I ...
Pacbio下机数据格式说明
RS II Sequel 在下机文件中，主要有三类文件，bam 文件，bam.pbi 文件，以及xml文件。当我们习惯性的去寻找熟悉的fastq格式文件做分析时，发现找不到了，因为在sequel平台中bam 文件成为了它的替代者，因为其更节约储存空间。这是文件格式的一个重大更新。用于后续分析 ...
h5文件简介
h5文件是层次格式的第5代版本,用于存储科学数据的一种文件格式和库文件,由美国超级计算中心与应用中心研发的文件格式,用以存储和组织大规模数据. H5将文件结构简化成两个主要的对象类型: 1 数据集dataset,就是同一类型数据的多维数组 2 组group,是一种容器结构,可以包含数据 ...
H5的简介
的能力。 优势：开发技术简单，研发周期短，用户接触成本低 一、H5的优势是兼容性好，用H5的技术开发 ...
H5的简介
1.H5的诞生 2.介绍 HTML5 将成为 HTML、XHTML 以及 HTML DOM 的新标准。 HTML5 是 W3C 与 WHATWG 合作的结果。 WHATWG 致力于 web 表单和应用程序，而 W3C 专注于 XHTML 2.0。在 2006 年 ...
H5 上传文件
Input <input type="file" /> 标签 type= "file" 时 定义支持上传的文件类型：设置 accept accept="image/bmp,image/jpeg,image/jpg,image/png" 支持的类型参考 ...