基因组组装工具之 SOAPdenovo 使用方法
SOAPdenovo是一个新颖的适用于组装短reads的方法，能组装出类似人类基因组大小的de novo草图。 该软件特地设计用来组装Illumina GA short reads，新的版本减少了在图创建时的内存消耗，解决了contig组装时的重复区域的问题，增加了scaffold组装时的覆盖度 ...
原文：SOAPdenovo组装软件使用记录
背景： 为什么要从头测序组装基因组 基因组是不同表型的遗传基础 获得参考基因组是深入研究一个生物体全基因组的第一步也是必须的一步 从头测序组装能够对新的测序物种构建参考基因组 为什么要研究全基因组 确定基因组中缺失了什么 确定难以生化研究的基因和pathways 研究感兴趣的pathway通路中的每一个基因 研究基因组的非编码区域 introns内含子 promoters启动子 telomeres ...
2017-05-27 13:57 0 5333 推荐指数：
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