Diamond软件比对蛋白质数据库
参考文章http://www.biotrainee.com/thread-1465-1-1.html http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102vny ...
原文：Uniprot 数据库-最常用的蛋白质数据库
Uniprot 数据库是收录信息最全面的蛋白质数据库，包含swissport, uniparc, TrEMBL 个子数据库 其中swiss prot 是手工核对过的 ，非冗余， 有详细注释信息的蛋白数据库，也是最常用的数据库 该数据库收录了不同物种的蛋白信息，以人类为例， 数据库中可以看到如下的信息： http: www.uniprot.org uniprot query amp fil orga ...
2017-05-15 10:53 0 4360 推荐指数：
相关推荐
Uniprot数据库
Uniprot数据库是Universal Protein的英文缩写，是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。 UniprotKB由两部分组成： UniProtKB/Swiss-Prot 高质量的、手工注释的、非冗余的数据集，这些数据都是由质量保证 ...
UniProt数据库怎么看
由于蛋白质组学的发展，使得蛋白质数据库也日益丰富，数据库的专一性及综合性均增强，而且，通过超文本的链接，可以使多个数据库进行相互的衔接。目前，关于蛋白质的结构，蛋白质质谱等数据库均较多，今天就来讲讲使用频率最高且冗余度最低的uniprot数据库。 拿到蛋白质组学鉴定结果后，看懂数据库 ...
UniProt数据库使用简介
UniProt数据库： UniProt数据库界面 structure 找有小分子共结晶的结构，方便做对接生成对接盒子 UniProt跳转到PDB 3D Report;Full Report 3D Report:NMR解析出来的有多个构象，把这些构象当成动力学模拟 ...
【宏蛋白质组】搜库工具简介与评估
宏蛋白质组数据分析相对较难，不同于常规蛋白质组分析，因为数据库太大，无法直接进行搜库匹配，需要对数据库进行优化。整理了几个发表的宏蛋白搜库分析工具。具体效果如何，还需要测试。 1.ProteoStorm 发表：ProteoStorm: An Ultrafast Metaproteomics ...
蛋白质组学数据的缺失值填充
缺失值填充在数据分析领域的预处理过程绕不过去的一个坎，蛋白质组学也不例外，简单记录下，可能有些地方有其特殊之处。 分析缺失值来源：完全随机缺失（MCAR，如质谱仪抖动，对数据影响无偏好性，均一分布），随机缺失（MAR，依赖于其他观测变量，如时间梯度越长采集越可能出现缺失值），非随机缺失 ...
蛋白质组学数据分析——（1）原理
当前，关于高通量蛋白质组学的研究远不如NGS这般火热，网上关于这方面的知识也寥寥无几，从事这一行也有一段时间了，但还没好好总结过。加之过段时间可能要去做培训，所以是时候把知识点总结一下，权当复习。当然整个蛋白质组学研究也算纷繁复杂，不可能面面俱到，而且很多东西我也在学习当中，肯定会出现不少纰漏 ...
互联网行业中最常用的数据库——MySQL数据库介绍
一、数据库的基本概念 1.1 使用数据库的必要性 使用数据库可以高效且条理分明地存储数据，使人们能够更加迅速、方便地管理数据。 数据库具有以下特点。（高效存储数据，方便管理数据） 可以结构化存储大量的数据信息，方便用户进行有效的检索和访问。（存储数据信息，检索和访问 ...