数据库,选定类别,基因名字类型,输出的就是整个数据库。 但是想调用这个函数没那么简单,得导入一系 ...
KEGG 官网提供了API, 可以方便的访问KEGG 数据库中的内容,链接如下: http: www.kegg.jp kegg rest keggapi.html 利用API可以得到某一个基因参与的pathway 信息, 以human 为例 第一步,获取每条pathway具体的描述信息 对应的API为 : http: rest.kegg.jp list pathway hsa 内容如下: 可以看到 ...
2017-05-12 15:43 0 3127 推荐指数:
数据库,选定类别,基因名字类型,输出的就是整个数据库。 但是想调用这个函数没那么简单,得导入一系 ...
KEGG PATHWAY Database KEGG PATHWAY 数据库是一个手工画的代谢通路的集合,包含以下几方面的分子间相互作用和反应网络: 1.新陈代谢 2.遗传信息加工 3.环境信息加工 4.细胞过程 5.生物体系统 6.人类 ...
1、https://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 2、如下图,筛选出基因所在的通路,并标上不同的颜色。 3、结果页面如下,有些基因会找不到对应的通路,如下图红字,找到通路的会列在下方,点击可以查看对应通路。 ...
上基因的存在情况。 最简单的方法是看公司给的KEGG注释或者直接下载本物种每个基因的注释结果(比如, ...
KEGG mapper: 输入:cufdiff生成的差异基因列表(log2fold_change的绝对值>1, pvalue<0.01) 目的:在KEGG网站中,利用KEGG mapper工具进行pathway注释。 过程: 1. ID转换:将gene symbol转换 ...
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c1f21000100utyx.html GO是Gene Ontology的简称,是生物学家为了衡量基因的功能而而发起的一个项目,从分子功能(molecular function)、生物学过程(biological process ...
学了这么久的Android,竟然一直对其API对应的名称关系一值搞不清楚,现在网上认真看了下资料,转载一个觉得写得不错的作者的文章,记下来: 【背景】 之前折腾android期间,慢慢地知道了,Android的版本,有个API Level,其实就是对应着某个Android发布版本的名称 ...
1、获取手机系统信息( CPU,厂商名称等) adb shell "cat /system/build.prop | grep "product"" 2、获取手机系统版本 adb shell getprop ro.build.version.release ...