CIRI 识别circRNA的原理
CIRI 根据circRNA 连接点处的reads来识别circRNA， 在连接点处的reads 其比对情况非常特殊； CIRI 根据3种模型来识别circRNA， 连接点处的read 叫做junction read A) circRNA 由3个外显子环化形成， 由于测序读长 ...
原文：circRNA 序列提取中的难点
在预测circRNA时，都是检测breakpoint 处的reads 数，最后给出的环状RNA的ID 都是诸如chr : 这样的形式，给出了起始和终止位置 对于某一个基因来说，其可能产生的circRNA的类型是多样的，以下图为例进行说明 由单个外显子组成的环状RNA, 比如 有多个外显子组成的环状RNA, 比如 以上的两种circRNA在序列提取时都非常容易，只需要将circRNA的起始和终止位置 ...
2017-04-19 17:31 0 2528 推荐指数：
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