基因组注释
基因组注释主要包括四个研究方向：重复序列的识别；非编码RNA的预测；基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1 重复序列的识别。 1.1 重复序列的研究背景和意义：重复序列可分为串联重复序列（Tendam repeat）和散在重复序列 ...
原文：R语言实现对基因组SNV进行注释
很多时候，我们需要对取出的SNV进行注释，这个时候可能会在R上进行注释，通常注释文件都含有Chr 染色体 Start 开始位点 End 结束位点 Description 描述 ，而我们的SNV文件通常是拥有Position 位置 ，因此我们可以先定位Chr，再用Postion去定位到Start和End之间，找到相对应的Description。为了加快速度，可以使用二分查找法。 在R中使用for循 ...
2017-04-07 20:50 0 1566 推荐指数：
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目录 简介 GS示例代码 简介 R包sommer内置了C++，运算速度还是比较快的，功能也很丰富，可求解各种复杂模型。语法相比于lme4包也要好懂一些。 建议查看文档：vignette("v1.sommer.quick.start") 混合线性模型 ...