生信基础概念之unique reads VS multi-mapping reads
unique reads:在参考组上只有一个匹配点 multi-mapping reads:在参考组上有多个匹配点 下面是tophat的一个结果案例： the quantity of unique reads ：25159791-1027691= the quantity ...
原文：unique mapped reads
就是指唯一比对的reads 现在人们已经开始避免使用unique mapped reads这个概念了，而转向使用mapq值来保留高质量的比对结果。因为mapq值反应了一组比对结果发生的可能性，MapQ log P , 比如结果为 ，那就是 的概率会出现这个比对结果，如果我们认为 . 是一个小概率的话，那个mapq值为 就可以用于筛选了, 如果认为 . 是个小概率的话，mapq值为 就可以用于筛选了 ...
2017-01-09 15:03 0 2017 推荐指数：
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