原文:测序中Q20 Q30 Q40

你能给别人讲清楚这个概念吗 二代测序中,每测一个碱基会给出一个相应的质量值,这个质量值是衡量测序准确度的。碱基的质量值 ,错误率为 , 的错误率为 , 的错误率为 . 。行业中Q 与Q 则表示质量值 或 的碱基所占百分比。例如一共测了 G的数据量,其中有 . G的碱基质量值大于或等于 ,那么Q 则为 。 Q 值是指的测序过程碱基识别 Base Calling 过程中,对所识别的碱基给出的错误概率。 ...

2017-01-09 14:40 0 15255 推荐指数:

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raw data/PF data/Q30 data/clean data的不同

测序数据拿回来之后,会给一些数据。那么这些数据代表什么呢? 1. 原始数据(Raw data):一次测序产生的全部原始数据。理论上,它们应该是没有经过任何过滤的,无论好坏。 2. PF数据(PF data):在测序过程,Illumina内置软件根据每个测序片段(read,通常每个片段长100 ...

Mon Jan 07 22:16:00 CST 2019 0 1086
统计 fastq 文件 q20 , GC 含量的软件

二代测序的分析过程,经常需要统计原始下机数据的数据量,看数据量是否符合要求;另外还需要统计q20,q30,GC含量等反应测序质量的指标; 在kseq.h 的基础上稍加改造,就可以实现从fastq 文件中统计这些指标的功能,而且速度非常的快 源代码保存为 parse.c ...

Tue Feb 14 22:56:00 CST 2017 6 2483
DjangoQ查询及Q()对象

DjangoQ查询及Q()对象 问题 一般我们在Django程序查询数据库操作都是在QuerySet里进行进行,例如下面代码: 或者将其组合起来,例如: 随着我们的程序越来越复杂,查询的条件也跟着复杂起来,这样简单的通过一个filter()来进行查询的条件将导致我们的查询越来越 ...

Tue Oct 22 04:10:00 CST 2019 0 1154
DjangoQ查询及Q()对象

问题 一般我们在Django程序查询数据库操作都是在QuerySet里进行进行,例如下面代码: >>> q1 = Entry.objects.filter(headline__startswith="What") >>> q ...

Tue Dec 12 23:23:00 CST 2017 0 17773
Angularjs的$q详解

先说说什么是Promise,什么是$q吧。Promise是一种异步处理模式,有很多的实现方式,比如著名的Kris Kwal's Q还有JQuery的Deffered。 什么是Promise 以前了解过Ajax的都能体会到回调的痛苦,同步的代码很容易调试,但是异步回调的代码,会让开 ...

Fri Jun 16 18:07:00 CST 2017 0 4420
Q-Q

来自:https://mp.weixin.qq.com/s/_UTKNcOgKQcCogk2C2tsQQ   正负样本数据集符合独立同分布是构建机器学习模型的前提,从概率的角度 ...

Fri Jan 04 00:01:00 CST 2019 0 1670
angular的$q详解

AngularJS 的Promise --- $q服务详解 先说说什么是Promise,什么是$q吧。Promise是一种异步处理模式,有很多的实现方式,比如著名的Kris Kwal's Q还有JQuery的Deffered ...

Fri Apr 27 06:46:00 CST 2018 0 1823
 
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