GCTA(全基因组复杂性状分析)工具开发目的是针对复杂性状的全基因组关联分析,评估SNP解释的表型方差所占的比例(该网站地址:http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可实现以下功能: 1 评估全基因组SNP的亲缘关系(遗传关系) 2 评估全 ...
如文章 Genome wide Complex Trait Analysis GCTA 全基因组复杂性状分析 中介绍的GCTA,是一款基于全基因组关联分析发展的分析工具,除了计算不同性状 表型间 traits 的遗传相关性外,还可以计算亲缘关系 近交系数 ,下面简单介绍如何利用GCTA计算不同性状 表型的遗传相关性。 一,在Linux上安装GCTA工具: wget r np pk nH P . t ...
2016-12-25 16:05 44 4801 推荐指数:
GCTA(全基因组复杂性状分析)工具开发目的是针对复杂性状的全基因组关联分析,评估SNP解释的表型方差所占的比例(该网站地址:http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可实现以下功能: 1 评估全基因组SNP的亲缘关系(遗传关系) 2 评估全 ...
这篇文章是对之前啊啊救救我,为何我的QQ图那么飘(全基因组关联分析)这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看显著SNP位点对表型是否为基因多效性外,还额外补充了怎么计算表型的遗传度和遗传相关性。 1 下载、安装ldsc git clone https://github.com ...
计算复杂度 计算复杂度由算法决定,一个数学问题通常可同时有多个解决算法,而计算复杂度可表述算法的复杂程度,在密码设计和密码分析中具有重要作用。计算复杂性理论不仅反映密码破译的固有困难性,评测密码算法对抗密码破译的实际能力,还能为不同密码算法实现难度的分析与比较提供了方法。 算法复杂 ...
遗传相关的计算之前介绍过几次了,感兴趣的翻之前的推文: 1、利用GCTA工具计算复杂性状/特征(Complex Trait)的遗传相关性(genetic correlation) 2、LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性 之前的两篇推文均有一个小局限,就是针对多个表型间的遗传 ...
NP完全性理论的奠基人—1982年度图灵奖得主斯蒂芬·库克 ---- 加拿大多伦多大学教授斯蒂芬·库克(Stephen Arthur Cook)因其在计算复杂性理论方面的突出贡献,尤其是在奠定NP完全性理论基础上的突出贡献而荣获1982年度的图灵奖。但库克实际上是美国科学家。 ----库克 ...
分析连续变量之间的线性相关程度的强弱 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素是相关密切程度。 1,图示初判 2,Pearson相关系数(皮尔逊相关系数) 3,Sperman秩相关系数(斯皮尔曼相关系数) 1,图示初判 (1)变量之间的线性相关性 ...
的不可计算 Kolmogorov复杂性的链式法则 压缩 Chaitin的不完备 ...
http://student.zjzk.cn/course_ware/software/txt/txt/show.asp?filename=11_3.txt 11.3 软件复杂性11.3.1 软件复杂性的基本概念 软件复杂性度量的参数很多,主要有: (1) 规模,即总共的指令数 ...