SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理
【怪毛匠子 整理】 samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步：把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步：sort 一下 BAM ...
原文：SAM/BAM文件处理
当测序得到的fastq文件map到基因组之后，我们通常会得到一个sam或者bam为扩展名的文件。SAM的全称是sequence alignment map format。而BAM就是SAM的二进制文件 B取自binary 。 那么SAM文件的格式是什么样子的呢 如果你想真实地了解SAM文件，可以查看它的说明文档。SAM由头文件和map结果组成。头文件由一行行以 起始的注释构成。而map结果是类似下 ...
2016-12-11 19:46 0 5502 推荐指数：
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