fastx_toolkit软件使用说明
高通量测序数据下机后的原始fastq文件，包含4行，其中一行为质量值，另外一行则为对应序列，我们都了解高通量的数据处理首先要进行质量控制，这些过程包括去接头、过滤低质量reads、去除低质量的3’和5’端，去除N较多的reads等，而针对高通量测序数据的质控软件也有很多，在这里给大家介绍一款“老牌 ...
原文：fastx_toolkit去除测序数据中的接头和低质量的reads
高通量测序数据下机后得到了fastq的raw data，通常测序公司在将数据返还给客户之前会做 clean 处理，即得到clean data。然而，这些clean data是否真的 clean 呢 首先，我们应该做一下质控。如果质控不合格，就需要一些处理，比如去接头 去除量的reads。 去除测序数据中的接头 用到的是fastx toolkit里面的fastx clipper工具 ： Usage: ...
2016-12-08 20:22 0 3025 推荐指数：
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