vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: 出来的结果图如下: 那么这幅图表明了什么含义呢? 首先看下输入数据 我们简单的看一下BCI这个数据,它的每一行代表了一个样本,不同样 ...
这周的作业我开始得好迟啊。。。然而还是要努力做啊。。。 我是萌萌哒分割线 首先,百度进入官方页面,看到这些: 也就是说,需要先安装permute和lattice包。那么,如何安装 呃 首先下载.tar.gz,然后在命令行 sudo R CMD INSTALL package.tar.gz 进入R环境,使用library 查看现在已经安装的包 我是超级无敌可爱的分割线 下面的内容来自vegan tu ...
2016-11-04 19:49 0 4301 推荐指数:
vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: 出来的结果图如下: 那么这幅图表明了什么含义呢? 首先看下输入数据 我们简单的看一下BCI这个数据,它的每一行代表了一个样本,不同样 ...
pheatmap包的安装 1: 首先R语言的安装路径里面最好不要有中文路径 2: 在安装其他依存的scales和colorspace包时候要关闭防火墙 错误提示: 试开URL’https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin ...
自动安装(在线安装) 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl="http://www.your.url", dependencies ...
Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析, 代码示例: 默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵 参考资料: https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics ...
Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合; 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 ...
R实际是通过命令操作软件,命令实际是在调用函数。 R包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合,包括R程序,运行该程序的其他语言(比如Java/C/Fortran),解释这个程序功能、方法的帮助文档,例子、测试数据等。 只有当一个包被载入时,它的内容才可以被访问。一些常用 ...
安装R语言中的外部包时,出现错误提示 试开URL’https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.3/ggplot2_2.2.1.zip'Content type 'application/zip' length ...
载入包 载入数据 绘制热图 生成行列注释 ...