原文:利用RNAseq数据做聚类分析

library ConsensusClusterPlus library factoextra library cluster library NbClust 读入数据data read.table T ex.txt ,header T, row.names b matrix data, nrow , ncol new lt as.matrix t data is.matrix new 标准化 m ...

2016-09-19 09:57 0 3782 推荐指数:

查看详情

利用SPSS对数据系统聚类分析

现用如下数据系统聚类分析: 将数据导入spss中,如图: 步骤如下: ①【分析】----【分类】----【系统聚类】 ②x2、x3、x4、x5、x6、x7、x8添加到变量,x1(即地区)添加到个案标注依据 小技巧:添加变量的时候,可以单击 ...

Thu Oct 07 03:20:00 CST 2021 0 269
matlab聚类分析

Matlab提供了两种方法进行聚类分析。 一种是利用 clusterdata函数对样本数据进行一次聚类,其缺点为可供用户选择的面较窄,不能更改距离的计算方法; 另一种是分步聚类:(1)找到数据集合中变量两两之间的相似性和非相似性,用pdist函数计算变量之间的距离 ...

Tue Jun 12 18:30:00 CST 2012 1 6453
matlab聚类分析

说明:如果是要用matlabkmeans聚类分析,直接使用函数kmeans即可。使用方法:kmeans(输入矩阵,分类个数k)。 转载一: MATLAB提供了两种方法进行聚类分析: 1、利用 clusterdata 函数对数据样本进行一次聚类 ...

Thu Apr 30 17:39:00 CST 2015 0 2125
使用clusterprofile聚类分析

library(clusterProfiler ) #cat test.txt gene_symbol EXOSC10ARHGEF10LVWA5B1SRRM1PTAFRCSMD2SH3GLB1G ...

Thu Sep 01 01:39:00 CST 2016 0 3433
数据挖掘——聚类分析总结

聚类分析 一、概念   聚类分析是按照个体的特征将他们分类,让同一个类别内的个体之间具有较高的相似度,不同类别之间具有较大的差异性   聚类分析属于无监督学习   聚类对象可以分为Q型聚类和R型聚类     Q型聚类:样本/记录聚类 以距离为相似性指标 (欧氏距离、欧氏平方距离 ...

Sat Oct 27 23:02:00 CST 2018 0 17917
SPSS聚类分析

聚类分析是根据对象的特性对其进行定量分类的一种多元统计方法。 比如:不同地区城镇居民收入和消费状况的分类研究;区域经济及社会发展水平的分析及全国区域经济综合评价....... 通常聚类分析分为Q型聚类分析和R型聚类分析。 Q型聚类分析:对样品的分类; R型聚类分析:对变量的分类。 通常聚类 ...

Sat Aug 21 23:12:00 CST 2021 0 260
SPSS聚类分析

定义 聚类分析(Cluster Analysis)又称群分析,是根据“物以类聚”的道理,对样品或指标进行分类的一种多元统计分析方法,它们讨论的对象是大量的样品,要求能合理地按各自的特性来进行合理的分类,没有任何模式可供参考或依循,即是在没有先验知识的情况下进行的。聚类分析起源于分类学,在古老 ...

Thu May 21 04:11:00 CST 2020 0 761
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM