构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb
如何下载NCBI blast数据库？ 有哪些可供下载的blast数据库？ blast如何使用？ blast构建索引 | makeblastdb ...
原文：ncbi-blast 本地安装
详见：http: blog.shenwei.me local blast installation Linux系统中NCBI BLAST 本地化教程 本文面向初学者 最好还是懂得基本的linux使用 ，高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法，一是因为思路一样，二是因为Linux中BLAST效率更高，系统更稳定，不会卡死。所以，请用Linux服务器，我想你也不忍心让自己心爱的本本跑几十 ...
2016-08-15 09:18 0 2572 推荐指数：
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基本局部比对搜索工具 (BLAST) 可查找两个序列之间具有局部相似性的区域。该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较，并计算匹配的统计显着性。BLAST 可用于推断序列之间的功能和进化关系，以及帮助识别基因家族的成员。 下载与安装 下载地址：https ...
blast的本地简单运行
一、软件配置 curl -O ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz tar zxvf ...
Linux下BLAST+的本地化（BLAST 2.2.29+）
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BLAST在Windows系统中本地化
简介 NCBI除了提供在线的Web BLAST序列比对服务外，还提供FTP方式下载序列比对工具。这允许在本地平台上针对从NCBI下载或本地创建的数据库执行BLAST搜索。这些实用程序没有图形用户界面，通过类似DOS的命令窗口运行，并通过基于文本的命令行开关接受输入 ...
blast+本地化中blastp操作(基于PDB库)—linux
blast+本地化的构建对于流程化处理大量数据序列很方便，blast+是将blast模块化，分为了蛋白质序列比对蛋白数据库(blastp)、核酸序列比对核酸数据库(blastn)、核酸序列比对蛋白质数据库(blastx)、蛋白质比对翻译后的核酸数据库(tblastn)、 翻译后的核酸序列比对翻译 ...
blast原理
blast的原理就是将想要明确注释的sequence（这个sequence就是query）先打断，即一条sequence变成多条sub-sequence（sub-sequence也就是word），然后拿这些sub-sequence与数据库中的序列比较（数据库中的序列是已经注释 ...