统计 fasta 文件序列长度及 GC 含量
注：该脚本适用于序列不断开的情况 可用一下命令将折行的序列合并为一行 运行脚本 升级版，输入文件是 fasta 格式即可。用 Bio 中的 Seq.IO 解析 fasta 文件， 用 python 的内置函数 count() 的计算速度更快。 ...
原文：perl练习——FASTA格式文件中序列GC含量计算&perl数组排序如何获得下标或者键
一 关于程序： FUN：计算FASTA文件中每条序列中G和C的含量百分比，输出最大值及其id INPUT：FASTA格式文件 gt seq CGCCGAGCGCTTGACCTCCAGCAAGACGCCGTCTGGCACATGCAACGAGCTGTAGCAGAC gt seq ATGCCTAGAACGTTCGAGACTTCTCGGGTGCGGTAGAATTAGCCATTCGACCGACTTCCA G ...
2016-07-04 17:01 0 3958 推荐指数：
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