命令行如下： plink --file FILENAME --make-bed --out FILENAME 　　第一个FILENAME的后缀为.ped和.map，生成的第二个FILENAME的后缀为.bed、.bim、.fam 参考链接： https ...

VCFtools can convert VCF files into formats convenient for use in other programs. One such example is the ability to convert into PLINK format. ...

plink1.9版本支持转化为VCFv4.2格式 plink2.0版本支持转化为VCFv4.3格式 两个版本用到的命令不一样 对于plink1.9版本，转化为vcf文件的命令行为： 生成的vcf为4.2版本 对于plink2.0版本，转化为vcf文件的命令行 ...

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BED 文件格式 BED 文件格式是一个可变方式的数据线，用来描述注释的数据。BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试结合低数字的字段必须流行如果高位字段被使用。 首先是三个要求的BED字段 chrom ...

bed文件（browse extensive data）以及gff文件（general fearture format） bed文件 第一列是染色体或者contig信息。 第二列是起始位置，从0开始。 第三列是终止位置。 第四列是bed列的名字。 第五列是score。 第六列是链方向 ...

1）BED文件 BED 文件(Browser Extensible Data)格式是ucsc 的genome browser的一个格式 ,提供了一种灵活的方式来定义的数据行，以用来描述注释信息。BED行有3个必须的列和9个额外可选的列。每行的数据格式要求一致(见下图)。 每条线的字段 ...

一般来说有两种解决方案。 第一种：添加“--plink-tped”参数： 用vcftools的“--plink”参数生成plink格式文件时，小样本量测试可以正常生成plink格式，用大样本量时产生Writing PLINK PED and MAP files ... Error ...