原文:fasta文件拆分与合并

Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: 如果从一个文件a提取第 至 个序列存到另一个文件b: awk v RS gt NR gt i i gt amp amp i lt print gt a.fasta sed d gt b.fasta 将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中: awk gt f d .fasta print gt f input.fasta FASTA文 ...

2016-03-23 12:29 0 3529 推荐指数:

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Perl FASTA文件拆分合并

1、合并并转化一代测序seq纯文本为fasta格式文件 2、合并文件夹下的纯文本文件 3、批量序列拼接 use strict; use warnings; open T, "<T_a.fas"; open R, "<R_a.fas ...

Tue Nov 13 19:01:00 CST 2018 0 788
C# 合并拆分PDF文件

一、合并拆分PDF文件的方式 PDF文件使用了工业标准的压缩算法,易于传输与储存。它还是页独立的,一个PDF文件包含一个或多个“页“,可以单独处理各页,特别适合多处理器系统的工作。PDF文件结构主要可以分为四个部分:首部、文件体、交叉引用表、尾部。PDF操作类库非常多,如下图所示,常用的类库 ...

Thu Jan 21 08:21:00 CST 2021 4 849
linux split命令拆分合并文件

split :可以将一个大文件分割成多个小文件,有时候需要将问卷分割成更小的片段,比如提高可读性,生成日志。 语法: split [OPTION]... [INPUT [PREFIX]] Output fixed-size pieces of INPUT to PREFIXaa ...

Fri Jul 26 19:33:00 CST 2019 0 1335
Linux大文件拆分合并、校验

Linux大文件拆分合并、校验 1.文件生成MD5码 2.文件拆分 3.拆分后生成子文件MD5码 4.子文件远程传输 5.在接收端校验子文件完整性 6.大文件合并 7.合并后的大文件生成MD5码 ...

Fri Aug 16 06:30:00 CST 2013 3 7988
C# 合并拆分PDF文件

C# 合并拆分PDF文件 有时我们可能会遇到下图这样一种情况 — 我们需要的资料或教程被分成了几部分存放在多个PDF文件中,不管是阅读还是保存都不是很方便,这时我们肯定想要把这些PDF文件合并为一个PDF文件。相对应的,有时候我们也需要拆分一个大的PDF文件,来从中获取我们需要的那一部分资料 ...

Wed Jun 22 01:17:00 CST 2016 3 6608
FASTA文件分割

FASTA格式是一种用于记录序列的文本格式,在生信分析中经常会用到.fasta文件中往往储存成千上万条序列,而在某些时候,需要对文件进行分割,如分割成每个序列一个文件,或分割成较小的fasta文件 假如有如下数据: Tricas1.fasta $ head Tricas1.fasta ...

Fri Feb 22 23:29:00 CST 2019 0 1208
txt文件转为fasta文件

inf = "/media/disk/CJX/Genechi/chi_sum_test.txt"outf= "/media/disk/CJX/Genechi/chi_sum_test2.txt"def ...

Fri Oct 11 06:11:00 CST 2019 0 919
fasta文件中序列的排序

同样的名为read_1.fa 的fasta文件,里面有若干序列,如: > ...

Thu May 18 06:03:00 CST 2017 0 1322
 
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