原文:【转】GATK使用方法详解(包含bwa使用)

一 使用GATK前须知事项: 对GATK的测试主要使用的是人类全基因组和外显子组的测序数据,而且全部是基于illumina数据格式,目前还没有提供其他格式文件 如Ion Torrent 或者实验设计 RNA Seq 的分析方法。 GATK是一个应用于前沿科学研究的软件,不断在更新和修正,因此,在使用GATK进行变异检测时,最好是下载最新的版本,目前的版本是 . . 。下载网站:http: www. ...

2015-12-30 16:45 0 4801 推荐指数:

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bwa使用方法

bwa使用需要两中输入文件: Reference genome data(fasta格式 .fa, .fasta, .fna) Short reads data (fastaq格式 .fastaq, .fq)step 1: 建立 Index根据reference genome ...

Fri Mar 06 03:17:00 CST 2015 0 23426
比对工具之 BWA 使用方法

BWA算法简介: BWA-bactrack BWA-SW BWA-MEM BWA安装: BWA使用步骤: 使用BWA构建参考基因组的index数据库 BWA-MEM比对(BWA-SW 和 BWA-backtrack用的少) 具体命令 ...

Tue Jun 21 02:59:00 CST 2016 0 14164
】Postman 使用方法详解

Postman背景介绍 用户在开发或者调试网络程序或者是网页B/S模式的程序的时候是需要一些方法来跟踪网页请求的,用户可以使用一些网络的监视工具比如著名的Firebug等网页调试工具。今天给大家介绍的这款网页调试工具不仅可以调试简单的css、html、脚本等简单的网页基本信息,它还可以发送 ...

Tue Jun 11 18:23:00 CST 2019 4 484
Pycharm使用方法详解

1、准备工作   (1)确认安装了Python解释器,版本2.4到3.4均可。   (2)注意Pycharm有两个发布版本:社区版和专业版,详见 Edition ...

Sat Feb 02 18:56:00 CST 2019 0 2836
for_each使用方法详解[]

Abstract之前在(原創) 如何使用for_each() algorithm? (C/C++) (STL) 曾經討論過for_each(),不過當時功力尚淺,只談到了皮毛而已,這次看了effective STL的item 41、43後,對for_each()又有了更深入的了解,因此做了本篇心得 ...

Mon May 28 04:40:00 CST 2012 2 32926
php中Session使用方法详解

自 https://blog.csdn.net/u014615166/article/details/53437869?tdsourcetag=s_pcqq_aiomsg Session的声明与使用   Session的设置不同于Cookie,必须先启动,在PHP中必须调用 ...

Thu Oct 18 20:48:00 CST 2018 0 692
BCGControlBar使用方法

、键盘等等)。BCGControlBar库包含了大约150多个经过精心设计,测试和具有完备文档的MFC扩 ...

Fri Mar 02 23:07:00 CST 2012 2 16917
 
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