一:导入R包及需要画热图的数据 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R练习/R测试数据/heatmapdata.txt",head = T,row.names=1,sep="\t") 二:画图 1)pheatmap(data)#默认参数 ...
快速实现是搜索帮助文档的首要目的,所以此处涉及实战的文章一概略去传统帮助文档的理论部分,直接上代码加注释 本文将介绍R语言下利用ggplot 包制作heatmap的代码 我是分割线 测试数据: 数据中的空白行 列用以分割heatmap,区别不同的数据处理,如不需要删除即可。 制作连续型 输出效果图: 分级别显示 输出效果图: 我是分割线 转载请注明出处 ...
2015-07-22 21:13 0 4941 推荐指数:
一:导入R包及需要画热图的数据 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R练习/R测试数据/heatmapdata.txt",head = T,row.names=1,sep="\t") 二:画图 1)pheatmap(data)#默认参数 ...
生成测试数据 绘图首先需要数据。通过生成一堆的向量,转换为矩阵,得到想要的数据。 data <- c(1:6, 6:1, 6:1, 1:6, (6:1)/10, ( ...
聚类分析:对样品或指标进行分类的一种分析方法,依据样本和指标已知特性进行分类。本节主要介绍层次聚类分析,一共包括3个部分,每个部分包括一个具体实战例子。 1、常规聚类过程: 一、首先用dist()函数计算变量间距离dist.r = dist(data, method ...
先来看两张图: (1)10年世界杯决赛,冠军西班牙队中门将、后卫、中场及前锋的跑位热图 通过热图,我们可以很清楚的看出四个球员在比赛中跑动位置的差异。 (2)历史地震震源位置的热图 也可以很清楚的看出,哪个地方是地震的高发地区(频率最高)。 HeatMap简介 上面两张就是热图 ...
HeatMap(热图)的原理和实现 先来看两张图: (1)10年世界杯决赛,冠军西班牙队中门将、后卫、中场及前锋的跑位热图 通过热图,我们可以很清楚的看出四个球员在比赛中跑动位置的差异。 (2)历史地震震源位置的热图 也可以很清楚的看出,哪个地方是地震的高发地区(频率最高 ...
这里利用Nathan Yau所著的《鲜活的数据:数据可视化指南》一书中的数据,学习画图。 数据地址:http://datasets.flowingdata.com/ppg2008.csv ...
Heatmap热图,可以非常直观的呈现一些原本不易理解或表达的数据,比如密度、频率、温度等,改用区域和颜色这种更容易被人理解的方式来呈现。热图实际上是三维可视化的俯瞰效果。(颜色代表一个维度)。 我们对热图并不陌生,教科书里、天气预报里的气温地图是最典型的案例。 在用户体验制胜的微创新 ...
http://jingyan.baidu.com/article/64d05a0240ec75de55f73bd8.html 利用Excel 2010及以上版本的“条件格式”--“色阶”功能可以制作热图(heatmap)。可选用Adobe ...