原文:MAFFT多重序列比对--(附比对彩标方法)

转记 MAFFT多重序列比对图解教程 絮语 一提到多重序列比对,很多人禁不住就想到ClustalW Clustalx为ClustalW的GUI版 ,其实有一款多重序列比对软件 MAFFT,不论从比对速度 Muscle gt MAFFT gt ClustalW gt T Coffee ,还是比对准确性 MAFFT gt Muscle gt T Coffee gt ClustalW 来说,其相比于C ...

2015-06-21 13:34 0 16209 推荐指数:

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MAFFT 进行多序列比对

简介 最经典和广为熟知的多序列比对软件是 clustalw 。 但是现有的多序列比对软件较多,有文献报道:比对速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee),比对准确性(MAFFT>Muscle>T-Coffee> ...

Mon Dec 30 03:01:00 CST 2019 0 2962
多重序列比对 CLUSTALX

【实验目的】 1、熟悉构建分子系统发生树的基本过程,获得使用不同建树方法、建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识; 2、掌握使用Clustalx进行序列多重比对的操作方法; 3、掌握使用Phylip软件构建系统发生树的操作方法。 【实验原理】 在现代分子进化研究中,根据现有生物基因 ...

Sat Oct 19 05:15:00 CST 2013 0 4737
MSA:多重比对序列的格式及其应用

多重比对序列的格式及其应用 这里对多重序列比对格式(Multiple sequence alignment – MSA)进行总结。在做系统演化分析、序列功能分析、基因预测等,都需要涉及到多重序列比对。特别是当需要用不同软件对多重比对序列进行批量操作时,会遇到各种的格式 ...

Thu Aug 28 02:15:00 CST 2014 0 2557
序列比对

文章转载于 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比对(或多序列联配,multiple sequence alignment,MSA),是指把多条(3 条或以上)有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对,尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一 ...

Sun Jul 16 05:43:00 CST 2017 0 1903
序列比对&建树

目录 目标物种和序列 相关Seq列表 多序列比对的原理和方法 相关的工具 建树的几种方法 实际操作 Muscle&ClustalW 可视化 ...

Mon Apr 06 09:05:00 CST 2020 0 669
序列比对-muscle & trimal

2021年了,从零开始几个字可以去掉了,做了很多次服务器搭建,其实能够叫零的之前已经是讲完了。 其实应该做一个总结,但是没有时间,后面再说吧。 本文也没有什么内容,因为很简单: ...

Fri Jan 29 03:09:00 CST 2021 0 580
序列比对那点事儿

序列比对那点事儿 2012-04-17 ~ ADMIN 本来这应该是一本书,那样的话的确需要花一点心思,就写成一篇短文吧。 从字符比对开始说起吧。第一个问题最简单,如何判断两个字符串是相等的。 int strcmp(const ...

Fri Oct 19 05:50:00 CST 2018 0 1405
Mega-序列比对

Aligning Sequences In this tutorial, we will show how to create a multiple sequence alignm ...

Thu Mar 05 21:09:00 CST 2020 0 2365
 
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