原文:15、R语言聚类树的绘图原理

聚类广泛用于数据分析。去年研究了一下R语言聚类树的绘图原理。以芯片分析为例,我们来给一些样品做聚类分析。聚类的方法有很多种,我们选择Pearson距离 ward方法。 选择的样品有: R语言代码实现Pearson聚类: R语言作图结果: 根据这几行代码,我们只知道使用cor.dist hclust plot这几个函数得到的结果,却看不出这些函数具体做了什么,也不太有人去深究这些问题。 事实上,R ...

2015-05-22 15:26 0 3734 推荐指数:

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R语言-聚类与分类

一.聚类:  一般步骤:   1.选择合适的变量   2.缩放数据   3.寻找异常点   4.计算距离   5.选择聚类算法   6.采用一种或多种聚类方法   7.确定类的数目   8.获得最终聚类的解决方案   9.结果可视化   10.解读类   11.验证 ...

Thu Mar 01 07:20:00 CST 2018 0 5996
R语言--聚类

一、定义:将物理或抽象对象的集合分成由类似的对象组成的多个类的过程被称为聚类 二、距离:欧几里得度量(euclidean metric)也称欧氏距离 绝对值距离(manhattan) Lance距离(canberra) 定性变量距离(binary ...

Fri Jul 02 23:31:00 CST 2021 0 326
R语言绘图——层次聚类图及树状图添加side bar

聚类分析作图往往包含热图(heatmap)和树状图(dendrogram)。热图用来展示每个样本点数值大小和聚集模式。树状图用来表示样本之间以及变量之间的距离远近(或者相似性大小)。R官网目前提供了至少45个可以绘制热图的包(packages),其中比较常见的、可以添加行列注释信息条的聚类作图包 ...

Mon Apr 20 05:55:00 CST 2020 0 2846
R语言绘图之plot

Quick-R: Graphs (statmethods.net) Quick-R: Scatterplots (statmethods.net) 数据分析师转向 R 的主要原因之一是其强大的图形功能。 在R中,图形通常是交互式创建的。 head(mtcars) #自带数据集 ...

Wed Jun 23 22:14:00 CST 2021 0 314
R语言绘图布局

R语言中,par 函数可以设置图形边距,其中oma 参数设置outer margin, mar 参数设置margin, 这些边距有什么不同呢,通过box函数可以直观的看到 box 默认在当前图形绘制边框,第一个参数which = "plot", 所以在当前图形上绘制边框 which 的值 ...

Fri Apr 21 17:58:00 CST 2017 0 10730
R语言——基本绘图函数

通过一个综合的例子测试绘图函数 学习的内容是tigerfish老师的教程。 第一节:基本知识 用seq函数产生100位学生的学号。 用runif函数产生100个随机数(随机数是小数),代表课程1的成绩,100个数字,最小值50,最大值100 ...

Mon Jun 23 08:35:00 CST 2014 0 8977
R语言绘图边框

R语言中, 绘图边框一共有3个区域: device region : figure region : plot region : 在描述不同区域大小的时候,有对应的不同参数: din : 返回device region 的宽度和高度, 单位为 inches fin : 返回 ...

Mon May 22 20:19:00 CST 2017 0 1941
 
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