原文:bwa的使用方法

bwa的使用需要两中输入文件: Reference genome data fasta格式 .fa, .fasta, .fna Short reads data fastaq格式 .fastaq, .fq step : 建立 Index根据reference genome data e.g. reference.fa 建立 Index File bwa index a bwtsw referenc ...

2015-03-05 19:17 0 23426 推荐指数:

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比对工具之 BWA 使用方法

BWA算法简介: BWA-bactrack BWA-SW BWA-MEM BWA安装: BWA使用步骤: 使用BWA构建参考基因组的index数据库 BWA-MEM比对(BWA-SW 和 BWA-backtrack用的少) 具体命令 ...

Tue Jun 21 02:59:00 CST 2016 0 14164
【转】GATK使用方法详解(包含bwa使用

一、使用GATK前须知事项: (1)对GATK的测试主要使用的是人类全基因组和外显子组的测序数据,而且全部是基于illumina数据格式,目前还没有提供其他格式文件(如Ion Torrent)或者实验设计(RNA-Seq)的分析方法。 (2)GATK是一个应用于前沿科学研究的软件,不断在更新 ...

Thu Dec 31 00:45:00 CST 2015 0 4801
linux下bwa和samtools的安装与使用

bwa的安装流程安装本软体总共需要完成以下两个软体的安装工作:1) BWA2) Samtools1.BWA的安装a.下载BWA (download from BWA Source Forge ) http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtmlb.安装BWA ...

Fri Mar 06 03:06:00 CST 2015 0 12620
RESTful使用方法

操作 并且使用PUT操作和DELETE操作时需在jsp页面添加隐藏的input标签,以 ...

Thu Jun 04 06:31:00 CST 2020 0 586
Iperf使用方法

Iperf使用方法 Iperf 是一个网络性能测试工具。Iperf可以测试TCP和UDP带宽质量。Iperf可以测量最大TCP带宽,具有多种参数和UDP特性。Iperf可以报告带宽,延迟抖动和数据包丢失。 Iperf使用方法与参数说明 参数说明 -s ...

Thu Jul 11 01:22:00 CST 2013 0 8470
ossutil使用方法

wget http://gosspublic.alicdn.com/ossutil/1.6.10/ossutil64官方链接https://help.aliyun.com/document_detai ...

Fri Sep 11 18:56:00 CST 2020 0 588
Bitbucket使用方法

,仍然使用Github的 二、创建一个私有项目及上传: 登录后鼠标悬停在“Repositories”选择“ ...

Thu Nov 08 21:58:00 CST 2012 0 31552
idhttpserver的使用方法

idhttpserver的使用方法 1)CommandGet(AContext: TIdContext; ARequestInfo: TIdHTTPRequestInfo; AResponseInfo: TIdHTTPResponseInfo);事件 该事件和IDTCPSERVER ...

Thu Nov 08 23:29:00 CST 2018 0 3319
 
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