原文:[bio] STAR 通用超快的RNA aligner

rnacallvarients时gatk推荐工具,broad institute都推荐了,还是encode计划时冷泉港内部开发的,特点:超级快速 minmap完 gb的reads as支持性好 支持长reads 全转录本 发现嵌合转录本等,有理由看一下。百度了下,没中文的博文,我来翻译一个吧 原理: STAR utilizes sequential maximum mappable seed se ...

2014-10-03 11:27 0 2582 推荐指数:

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通用块层bio详解

Linux Block 层在 Linux 内核设计之初就作为几大子系统存在,当然这也是得益于他的前辈 Unix 等优秀的设计。作为 IO 子系统的中间层,他为上层输出接口,为下层提供数据,像个勤劳的小蜜蜂,本文介绍通用块层中的最具传奇色彩的 bio,他就像是一个原子,是在整个 block 层的最小 ...

Tue Dec 03 18:32:00 CST 2019 0 480
微人事 star 10k,如何打造一个 star 10k 的开源项目

看了下,微人事(https://github.com/lenve/vhr)项目 star 10k 啦,松哥第一个 star 数过万的开源项目就这样诞生了。 两年前差不多就是现在这个时候,松哥所在的公司业绩下滑严重,关门倒闭已成定局,很多同事在谋划的新的出路,松哥则被公司留下来善后 ...

Tue Oct 15 18:46:00 CST 2019 1 1339
montreal-forced-aligner

下载: https://github.com/MontrealCorpusTools/Montreal-Forced-Aligner/releases/tag/v1.0.1 然后,解压tar -zxvf montreal-forced-aligner ...

Sun Apr 04 09:51:00 CST 2021 0 431
RNA velocity | RNA速率

单细胞转录组确实是利器,但我们大多只利用了表达的信息,而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了。 最近nature发了一篇单细胞方法类文章,讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...

Mon Aug 20 20:19:00 CST 2018 0 2390
2021 github java领域40k star项目,top10 拿走,不谢

2021 github java领域40k star项目,top10 拿走,不谢 原创2021-07-24 00:23·undergrowth CyC2018/CS-Notes 技术面试的必备知识,官方网站----http://www.cyc2018.xyz/,主要是涉及计算机 ...

Wed Jul 28 17:36:00 CST 2021 0 161
Forest v1.5.13 发布,声明式 HTTP 框架,已 1.7k star

Forest介绍 Forest 是一个开源的 Java HTTP 客户端框架,它能够将 HTTP 的所有请求信息(包括 URL、Header 以及 Body 等信息)绑定到您自定义的 Interface 方法上,能够通过调用本地接口方法的方式发送 HTTP 请求 现已超过 1700 star ...

Tue Nov 16 23:28:00 CST 2021 0 320
 
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