甲基化分析中limma包中的logFC值是怎么来的
最近在做甲基化分析，看到logFC值，突然好奇这个值是怎么转化过来的。 测试了一下，limma的logFC值与glm函数的Estimate值是一样的。 以下是limma包的结果，可以看到 logFC值为-0.09222974： 以下是glm函数的结果： logFC值用公式来表示 ...
原文：limma包的使用技巧
limmar package是一个功能比较全的包，既含有cDNA芯片的RAW data输入 前处理 归一化 功能，同时也有差异化基因分析的 线性 算法 limma: Linear Models for Microarray Data ，特别是对于 多因素实验 multifactor designed experiment 。limmar包的可扩展性非常强，单通道 one channel 或者双通道 ...
2014-05-06 16:44 0 10505 推荐指数：
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