原文:AUGUSTUS安装 基因训练、预测软件

Augustus的安装和使用参数 AUGUSTUSis a program that predicts genes in eukaryotic genomic sequences. . Augustus的安装 Augustus下载:http: bioinf.uni greifswald.de augustus binaries . Augustus使用方法 . 基因预测例子 . Augustus使 ...

2014-01-07 09:57 0 5947 推荐指数:

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Augustus 进行基因注释

目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论,通过已有物种的注释信息对软件进行训练,从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构,在这方面做的最好的工具是 AUGUSTUS它可以仅使用序列信息进行预测,也可以整合EST, cDNA, RNA-seq ...

Tue Feb 25 16:48:00 CST 2020 1 2544
Augustus 进行基因注释

目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论,通过已有物种的注释信息对软件进行训练,从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构,在这方面做的最好的工具是AUGUSTUS它可以仅使用序列信息进行预测,也可以整合EST, cDNA, RNA-seq数据作为先验模型进行预测 ...

Tue Apr 07 17:04:00 CST 2020 0 964
基于PASA进行基因预测

PASA, acronym for Program to Assemble Spliced Alignments, is a eukaryotic genome annotation tool tha ...

Tue Mar 10 23:39:00 CST 2020 0 2124
ResNet网络的训练预测

ResNet网络的训练预测 简介 Introduction 图像分类与CNN 图像分类 是指将图像信息中所反映的不同特征,把不同类别的目标区分开来的图像处理方法,是计算机视觉中其他任务,比如目标检测、语义分割、人脸识别等高层视觉任务的基础。 ImageNet 大规模视觉识别挑战赛 ...

Tue Feb 16 14:59:00 CST 2021 0 328
基因组序列注释 (基因结构预测

基因组组装完后需要对基因组序列进行注释。注释前首先得构建基因模型,有三种策略: 同源预测(homology-based prediction):有一些基因蛋白在相近物种间的保守型高,所以可以使用已有的高质量近缘物种注释信息通过序列联配的方式确定外显子边界和剪切位点 基于转录组预测 ...

Sun Dec 22 01:29:00 CST 2019 0 4736
tRNAscan-SE 预测tRNA基因

tRNAscan-SE 软件可以根据输入的基因组序列,预测对应的tRNA的基因 在线的tRNAscan-SE的链接如下:http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/ 如下图所示,只需要输入fasta 格式的序列,选择对应的物种类型和其他的一些选项,点击运行按钮即可 ...

Thu Jun 29 19:16:00 CST 2017 0 1749
 
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